Protein–RNA interactions for Protein: Q6KCD5

Nipbl, Nipped-B-like protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,798 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NipblQ6KCD5 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
NipblQ6KCD5 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
NipblQ6KCD5 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NipblQ6KCD5 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NipblQ6KCD5 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NipblQ6KCD5 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NipblQ6KCD5 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
NipblQ6KCD5 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NipblQ6KCD5 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
NipblQ6KCD5 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
NipblQ6KCD5 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
NipblQ6KCD5 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NipblQ6KCD5 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NipblQ6KCD5 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
NipblQ6KCD5 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NipblQ6KCD5 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NipblQ6KCD5 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
NipblQ6KCD5 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
NipblQ6KCD5 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
NipblQ6KCD5 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
NipblQ6KCD5 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NipblQ6KCD5 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NipblQ6KCD5 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
NipblQ6KCD5 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NipblQ6KCD5 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
NipblQ6KCD5 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NipblQ6KCD5 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NipblQ6KCD5 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NipblQ6KCD5 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
NipblQ6KCD5 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NipblQ6KCD5 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NipblQ6KCD5 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NipblQ6KCD5 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NipblQ6KCD5 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NipblQ6KCD5 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NipblQ6KCD5 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NipblQ6KCD5 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NipblQ6KCD5 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NipblQ6KCD5 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NipblQ6KCD5 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NipblQ6KCD5 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NipblQ6KCD5 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
NipblQ6KCD5 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NipblQ6KCD5 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NipblQ6KCD5 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NipblQ6KCD5 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
NipblQ6KCD5 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
NipblQ6KCD5 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NipblQ6KCD5 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NipblQ6KCD5 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NipblQ6KCD5 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NipblQ6KCD5 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
NipblQ6KCD5 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
NipblQ6KCD5 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC16.58■□□□□ 0.25
NipblQ6KCD5 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
NipblQ6KCD5 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NipblQ6KCD5 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
NipblQ6KCD5 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
NipblQ6KCD5 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NipblQ6KCD5 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NipblQ6KCD5 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NipblQ6KCD5 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NipblQ6KCD5 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NipblQ6KCD5 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NipblQ6KCD5 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NipblQ6KCD5 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NipblQ6KCD5 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NipblQ6KCD5 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NipblQ6KCD5 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NipblQ6KCD5 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NipblQ6KCD5 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
NipblQ6KCD5 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NipblQ6KCD5 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NipblQ6KCD5 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NipblQ6KCD5 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
NipblQ6KCD5 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NipblQ6KCD5 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NipblQ6KCD5 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NipblQ6KCD5 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
NipblQ6KCD5 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NipblQ6KCD5 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
NipblQ6KCD5 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NipblQ6KCD5 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NipblQ6KCD5 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NipblQ6KCD5 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NipblQ6KCD5 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NipblQ6KCD5 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NipblQ6KCD5 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
NipblQ6KCD5 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NipblQ6KCD5 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NipblQ6KCD5 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NipblQ6KCD5 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NipblQ6KCD5 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NipblQ6KCD5 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NipblQ6KCD5 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NipblQ6KCD5 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NipblQ6KCD5 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NipblQ6KCD5 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NipblQ6KCD5 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NipblQ6KCD5 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.2 ms