Protein–RNA interactions for Protein: Q6IRU5

Cltb, Clathrin light chain B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 229 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CltbQ6IRU5 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
CltbQ6IRU5 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC19.63■□□□□ 0.73
CltbQ6IRU5 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC19.63■□□□□ 0.73
CltbQ6IRU5 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
CltbQ6IRU5 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
CltbQ6IRU5 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
CltbQ6IRU5 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
CltbQ6IRU5 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
CltbQ6IRU5 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
CltbQ6IRU5 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CltbQ6IRU5 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CltbQ6IRU5 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
CltbQ6IRU5 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CltbQ6IRU5 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
CltbQ6IRU5 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
CltbQ6IRU5 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
CltbQ6IRU5 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CltbQ6IRU5 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CltbQ6IRU5 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CltbQ6IRU5 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CltbQ6IRU5 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CltbQ6IRU5 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CltbQ6IRU5 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CltbQ6IRU5 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CltbQ6IRU5 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
CltbQ6IRU5 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CltbQ6IRU5 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
CltbQ6IRU5 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
CltbQ6IRU5 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CltbQ6IRU5 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CltbQ6IRU5 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CltbQ6IRU5 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CltbQ6IRU5 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CltbQ6IRU5 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CltbQ6IRU5 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CltbQ6IRU5 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CltbQ6IRU5 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
CltbQ6IRU5 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CltbQ6IRU5 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CltbQ6IRU5 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CltbQ6IRU5 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
CltbQ6IRU5 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
CltbQ6IRU5 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
CltbQ6IRU5 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
CltbQ6IRU5 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CltbQ6IRU5 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CltbQ6IRU5 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
CltbQ6IRU5 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CltbQ6IRU5 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CltbQ6IRU5 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CltbQ6IRU5 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CltbQ6IRU5 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CltbQ6IRU5 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CltbQ6IRU5 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CltbQ6IRU5 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CltbQ6IRU5 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
CltbQ6IRU5 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CltbQ6IRU5 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CltbQ6IRU5 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CltbQ6IRU5 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CltbQ6IRU5 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CltbQ6IRU5 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
CltbQ6IRU5 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CltbQ6IRU5 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CltbQ6IRU5 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CltbQ6IRU5 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CltbQ6IRU5 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CltbQ6IRU5 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CltbQ6IRU5 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
CltbQ6IRU5 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
CltbQ6IRU5 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CltbQ6IRU5 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CltbQ6IRU5 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CltbQ6IRU5 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CltbQ6IRU5 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CltbQ6IRU5 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CltbQ6IRU5 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CltbQ6IRU5 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CltbQ6IRU5 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CltbQ6IRU5 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CltbQ6IRU5 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CltbQ6IRU5 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CltbQ6IRU5 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
CltbQ6IRU5 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CltbQ6IRU5 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CltbQ6IRU5 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CltbQ6IRU5 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CltbQ6IRU5 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CltbQ6IRU5 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CltbQ6IRU5 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CltbQ6IRU5 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CltbQ6IRU5 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CltbQ6IRU5 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CltbQ6IRU5 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CltbQ6IRU5 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CltbQ6IRU5 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CltbQ6IRU5 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CltbQ6IRU5 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
CltbQ6IRU5 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
CltbQ6IRU5 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.4 ms