Protein–RNA interactions for Protein: Q6IFX3

Krt40, Keratin, type I cytoskeletal 40, mousemouse

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Length 439 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt40Q6IFX3 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Krt40Q6IFX3 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Krt40Q6IFX3 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Krt40Q6IFX3 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
Krt40Q6IFX3 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Krt40Q6IFX3 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
Krt40Q6IFX3 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Krt40Q6IFX3 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Krt40Q6IFX3 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Krt40Q6IFX3 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Krt40Q6IFX3 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Krt40Q6IFX3 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Krt40Q6IFX3 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
Krt40Q6IFX3 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
Krt40Q6IFX3 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Krt40Q6IFX3 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
Krt40Q6IFX3 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Krt40Q6IFX3 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Krt40Q6IFX3 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Krt40Q6IFX3 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Krt40Q6IFX3 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Krt40Q6IFX3 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Krt40Q6IFX3 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Krt40Q6IFX3 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Krt40Q6IFX3 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Krt40Q6IFX3 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Krt40Q6IFX3 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Krt40Q6IFX3 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Krt40Q6IFX3 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Krt40Q6IFX3 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Krt40Q6IFX3 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Krt40Q6IFX3 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Krt40Q6IFX3 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Krt40Q6IFX3 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Krt40Q6IFX3 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Krt40Q6IFX3 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Krt40Q6IFX3 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Krt40Q6IFX3 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Krt40Q6IFX3 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Krt40Q6IFX3 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Krt40Q6IFX3 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Krt40Q6IFX3 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Krt40Q6IFX3 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Krt40Q6IFX3 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Krt40Q6IFX3 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Krt40Q6IFX3 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Krt40Q6IFX3 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Krt40Q6IFX3 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Krt40Q6IFX3 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Krt40Q6IFX3 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Krt40Q6IFX3 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Krt40Q6IFX3 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Krt40Q6IFX3 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Krt40Q6IFX3 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Krt40Q6IFX3 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
Krt40Q6IFX3 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
Krt40Q6IFX3 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Krt40Q6IFX3 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Krt40Q6IFX3 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Krt40Q6IFX3 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
Krt40Q6IFX3 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Krt40Q6IFX3 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Krt40Q6IFX3 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Krt40Q6IFX3 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Krt40Q6IFX3 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Krt40Q6IFX3 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Krt40Q6IFX3 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Krt40Q6IFX3 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Krt40Q6IFX3 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Krt40Q6IFX3 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Krt40Q6IFX3 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Krt40Q6IFX3 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
Krt40Q6IFX3 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
Krt40Q6IFX3 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Krt40Q6IFX3 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Krt40Q6IFX3 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Krt40Q6IFX3 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Krt40Q6IFX3 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
Krt40Q6IFX3 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Krt40Q6IFX3 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Krt40Q6IFX3 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
Krt40Q6IFX3 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Krt40Q6IFX3 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Krt40Q6IFX3 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Krt40Q6IFX3 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Krt40Q6IFX3 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Krt40Q6IFX3 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Krt40Q6IFX3 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Krt40Q6IFX3 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Krt40Q6IFX3 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Krt40Q6IFX3 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Krt40Q6IFX3 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Krt40Q6IFX3 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Krt40Q6IFX3 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Krt40Q6IFX3 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Krt40Q6IFX3 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Krt40Q6IFX3 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Krt40Q6IFX3 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Krt40Q6IFX3 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Krt40Q6IFX3 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
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