Protein–RNA interactions for Protein: Q6GQV7

Edrf1, Erythroid differentiation-related factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Edrf1Q6GQV7 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Edrf1Q6GQV7 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Edrf1Q6GQV7 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Edrf1Q6GQV7 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Edrf1Q6GQV7 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Edrf1Q6GQV7 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Edrf1Q6GQV7 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Edrf1Q6GQV7 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Edrf1Q6GQV7 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Edrf1Q6GQV7 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Edrf1Q6GQV7 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Edrf1Q6GQV7 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Edrf1Q6GQV7 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Edrf1Q6GQV7 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Edrf1Q6GQV7 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Edrf1Q6GQV7 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Edrf1Q6GQV7 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Edrf1Q6GQV7 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Edrf1Q6GQV7 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Edrf1Q6GQV7 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Edrf1Q6GQV7 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Edrf1Q6GQV7 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Edrf1Q6GQV7 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Edrf1Q6GQV7 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Edrf1Q6GQV7 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Edrf1Q6GQV7 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Edrf1Q6GQV7 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Edrf1Q6GQV7 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
Edrf1Q6GQV7 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Edrf1Q6GQV7 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Edrf1Q6GQV7 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
Edrf1Q6GQV7 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Edrf1Q6GQV7 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Edrf1Q6GQV7 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Edrf1Q6GQV7 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
Edrf1Q6GQV7 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
Edrf1Q6GQV7 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Edrf1Q6GQV7 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Edrf1Q6GQV7 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Edrf1Q6GQV7 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Edrf1Q6GQV7 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
Edrf1Q6GQV7 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Edrf1Q6GQV7 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Edrf1Q6GQV7 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Edrf1Q6GQV7 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Edrf1Q6GQV7 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Edrf1Q6GQV7 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
Edrf1Q6GQV7 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Edrf1Q6GQV7 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Edrf1Q6GQV7 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Edrf1Q6GQV7 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Edrf1Q6GQV7 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Edrf1Q6GQV7 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Edrf1Q6GQV7 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Edrf1Q6GQV7 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Edrf1Q6GQV7 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
Edrf1Q6GQV7 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Edrf1Q6GQV7 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Edrf1Q6GQV7 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Edrf1Q6GQV7 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Edrf1Q6GQV7 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Edrf1Q6GQV7 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Edrf1Q6GQV7 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Edrf1Q6GQV7 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Edrf1Q6GQV7 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Edrf1Q6GQV7 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Edrf1Q6GQV7 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Edrf1Q6GQV7 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Edrf1Q6GQV7 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Edrf1Q6GQV7 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Edrf1Q6GQV7 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Edrf1Q6GQV7 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Edrf1Q6GQV7 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Edrf1Q6GQV7 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Edrf1Q6GQV7 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Edrf1Q6GQV7 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Edrf1Q6GQV7 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Edrf1Q6GQV7 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Edrf1Q6GQV7 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Edrf1Q6GQV7 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Edrf1Q6GQV7 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Edrf1Q6GQV7 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Edrf1Q6GQV7 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Edrf1Q6GQV7 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Edrf1Q6GQV7 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Edrf1Q6GQV7 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Edrf1Q6GQV7 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Edrf1Q6GQV7 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
Edrf1Q6GQV7 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Edrf1Q6GQV7 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Edrf1Q6GQV7 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Edrf1Q6GQV7 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Edrf1Q6GQV7 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
Edrf1Q6GQV7 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Edrf1Q6GQV7 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Edrf1Q6GQV7 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Edrf1Q6GQV7 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Edrf1Q6GQV7 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Edrf1Q6GQV7 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Edrf1Q6GQV7 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 401.7 ms