Protein–RNA interactions for Protein: Q6DFV6

Fndc3c1, Fibronectin type III domain containing protein 3C1, mousemouse

Predictions only

Length 1,356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fndc3c1Q6DFV6 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Fndc3c1Q6DFV6 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Fndc3c1Q6DFV6 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Fndc3c1Q6DFV6 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Fndc3c1Q6DFV6 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Fndc3c1Q6DFV6 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Fndc3c1Q6DFV6 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Fndc3c1Q6DFV6 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Fndc3c1Q6DFV6 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Fndc3c1Q6DFV6 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Fndc3c1Q6DFV6 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Fndc3c1Q6DFV6 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Fndc3c1Q6DFV6 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Fndc3c1Q6DFV6 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Fndc3c1Q6DFV6 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC24.64■■□□□ 1.53
Fndc3c1Q6DFV6 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC24.64■■□□□ 1.53
Fndc3c1Q6DFV6 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.53
Fndc3c1Q6DFV6 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Fndc3c1Q6DFV6 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Fndc3c1Q6DFV6 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Fndc3c1Q6DFV6 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
Fndc3c1Q6DFV6 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Fndc3c1Q6DFV6 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Fndc3c1Q6DFV6 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Fndc3c1Q6DFV6 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Fndc3c1Q6DFV6 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Fndc3c1Q6DFV6 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Fndc3c1Q6DFV6 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Fndc3c1Q6DFV6 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Fndc3c1Q6DFV6 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Fndc3c1Q6DFV6 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Fndc3c1Q6DFV6 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
Fndc3c1Q6DFV6 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Fndc3c1Q6DFV6 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Fndc3c1Q6DFV6 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Fndc3c1Q6DFV6 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Fndc3c1Q6DFV6 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Fndc3c1Q6DFV6 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Fndc3c1Q6DFV6 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Fndc3c1Q6DFV6 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Fndc3c1Q6DFV6 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Fndc3c1Q6DFV6 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Fndc3c1Q6DFV6 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Fndc3c1Q6DFV6 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Fndc3c1Q6DFV6 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Fndc3c1Q6DFV6 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Fndc3c1Q6DFV6 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Fndc3c1Q6DFV6 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Fndc3c1Q6DFV6 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Fndc3c1Q6DFV6 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Fndc3c1Q6DFV6 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Fndc3c1Q6DFV6 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
Fndc3c1Q6DFV6 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Fndc3c1Q6DFV6 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Fndc3c1Q6DFV6 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Fndc3c1Q6DFV6 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Fndc3c1Q6DFV6 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
Fndc3c1Q6DFV6 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Fndc3c1Q6DFV6 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Fndc3c1Q6DFV6 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
Fndc3c1Q6DFV6 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Fndc3c1Q6DFV6 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Fndc3c1Q6DFV6 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Fndc3c1Q6DFV6 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Fndc3c1Q6DFV6 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Fndc3c1Q6DFV6 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Fndc3c1Q6DFV6 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Fndc3c1Q6DFV6 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Fndc3c1Q6DFV6 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Fndc3c1Q6DFV6 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
Fndc3c1Q6DFV6 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Fndc3c1Q6DFV6 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Fndc3c1Q6DFV6 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Fndc3c1Q6DFV6 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Fndc3c1Q6DFV6 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Fndc3c1Q6DFV6 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Fndc3c1Q6DFV6 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Fndc3c1Q6DFV6 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Fndc3c1Q6DFV6 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Fndc3c1Q6DFV6 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Fndc3c1Q6DFV6 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Fndc3c1Q6DFV6 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Fndc3c1Q6DFV6 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Fndc3c1Q6DFV6 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Fndc3c1Q6DFV6 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Fndc3c1Q6DFV6 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Fndc3c1Q6DFV6 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Fndc3c1Q6DFV6 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Fndc3c1Q6DFV6 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Fndc3c1Q6DFV6 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Fndc3c1Q6DFV6 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Fndc3c1Q6DFV6 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Fndc3c1Q6DFV6 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Fndc3c1Q6DFV6 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Fndc3c1Q6DFV6 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Fndc3c1Q6DFV6 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Fndc3c1Q6DFV6 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Fndc3c1Q6DFV6 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Fndc3c1Q6DFV6 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Fndc3c1Q6DFV6 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 91.7 ms