Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZZ6

Tmcc1, Transmembrane and coiled-coil domains protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 649 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmcc1Q69ZZ6 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tmcc1Q69ZZ6 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tmcc1Q69ZZ6 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tmcc1Q69ZZ6 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tmcc1Q69ZZ6 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tmcc1Q69ZZ6 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tmcc1Q69ZZ6 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tmcc1Q69ZZ6 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tmcc1Q69ZZ6 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tmcc1Q69ZZ6 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tmcc1Q69ZZ6 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Tmcc1Q69ZZ6 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tmcc1Q69ZZ6 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tmcc1Q69ZZ6 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tmcc1Q69ZZ6 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Tmcc1Q69ZZ6 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tmcc1Q69ZZ6 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tmcc1Q69ZZ6 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tmcc1Q69ZZ6 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tmcc1Q69ZZ6 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tmcc1Q69ZZ6 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Tmcc1Q69ZZ6 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Tmcc1Q69ZZ6 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Tmcc1Q69ZZ6 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Tmcc1Q69ZZ6 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Tmcc1Q69ZZ6 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Tmcc1Q69ZZ6 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Tmcc1Q69ZZ6 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Tmcc1Q69ZZ6 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Tmcc1Q69ZZ6 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Tmcc1Q69ZZ6 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Tmcc1Q69ZZ6 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
Tmcc1Q69ZZ6 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Tmcc1Q69ZZ6 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Tmcc1Q69ZZ6 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Tmcc1Q69ZZ6 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Tmcc1Q69ZZ6 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Tmcc1Q69ZZ6 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Tmcc1Q69ZZ6 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Tmcc1Q69ZZ6 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Tmcc1Q69ZZ6 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Tmcc1Q69ZZ6 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Tmcc1Q69ZZ6 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Tmcc1Q69ZZ6 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Tmcc1Q69ZZ6 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Tmcc1Q69ZZ6 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Tmcc1Q69ZZ6 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tmcc1Q69ZZ6 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Tmcc1Q69ZZ6 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Tmcc1Q69ZZ6 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Tmcc1Q69ZZ6 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Tmcc1Q69ZZ6 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Tmcc1Q69ZZ6 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Tmcc1Q69ZZ6 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Tmcc1Q69ZZ6 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Tmcc1Q69ZZ6 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Tmcc1Q69ZZ6 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Tmcc1Q69ZZ6 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Tmcc1Q69ZZ6 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Tmcc1Q69ZZ6 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Tmcc1Q69ZZ6 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
Tmcc1Q69ZZ6 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Tmcc1Q69ZZ6 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
Tmcc1Q69ZZ6 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tmcc1Q69ZZ6 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tmcc1Q69ZZ6 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tmcc1Q69ZZ6 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tmcc1Q69ZZ6 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tmcc1Q69ZZ6 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tmcc1Q69ZZ6 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tmcc1Q69ZZ6 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tmcc1Q69ZZ6 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tmcc1Q69ZZ6 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tmcc1Q69ZZ6 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tmcc1Q69ZZ6 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tmcc1Q69ZZ6 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tmcc1Q69ZZ6 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tmcc1Q69ZZ6 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tmcc1Q69ZZ6 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tmcc1Q69ZZ6 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tmcc1Q69ZZ6 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tmcc1Q69ZZ6 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tmcc1Q69ZZ6 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tmcc1Q69ZZ6 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tmcc1Q69ZZ6 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tmcc1Q69ZZ6 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tmcc1Q69ZZ6 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tmcc1Q69ZZ6 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tmcc1Q69ZZ6 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tmcc1Q69ZZ6 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Tmcc1Q69ZZ6 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Tmcc1Q69ZZ6 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Tmcc1Q69ZZ6 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Tmcc1Q69ZZ6 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Tmcc1Q69ZZ6 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Tmcc1Q69ZZ6 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Tmcc1Q69ZZ6 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Tmcc1Q69ZZ6 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Tmcc1Q69ZZ6 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Tmcc1Q69ZZ6 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms