Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZB8

Zcchc2, Zinc finger CCHC domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,166 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zcchc2Q69ZB8 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Zcchc2Q69ZB8 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Zcchc2Q69ZB8 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Zcchc2Q69ZB8 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Zcchc2Q69ZB8 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Zcchc2Q69ZB8 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Zcchc2Q69ZB8 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Zcchc2Q69ZB8 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Zcchc2Q69ZB8 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Zcchc2Q69ZB8 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Zcchc2Q69ZB8 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Zcchc2Q69ZB8 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Zcchc2Q69ZB8 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Zcchc2Q69ZB8 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Zcchc2Q69ZB8 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Zcchc2Q69ZB8 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Zcchc2Q69ZB8 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Zcchc2Q69ZB8 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Zcchc2Q69ZB8 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Zcchc2Q69ZB8 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Zcchc2Q69ZB8 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
Zcchc2Q69ZB8 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Zcchc2Q69ZB8 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Zcchc2Q69ZB8 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Zcchc2Q69ZB8 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Zcchc2Q69ZB8 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Zcchc2Q69ZB8 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Zcchc2Q69ZB8 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Zcchc2Q69ZB8 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Zcchc2Q69ZB8 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Zcchc2Q69ZB8 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Zcchc2Q69ZB8 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Zcchc2Q69ZB8 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Zcchc2Q69ZB8 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Zcchc2Q69ZB8 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Zcchc2Q69ZB8 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Zcchc2Q69ZB8 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Zcchc2Q69ZB8 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Zcchc2Q69ZB8 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Zcchc2Q69ZB8 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Zcchc2Q69ZB8 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Zcchc2Q69ZB8 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Zcchc2Q69ZB8 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Zcchc2Q69ZB8 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Zcchc2Q69ZB8 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Zcchc2Q69ZB8 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Zcchc2Q69ZB8 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Zcchc2Q69ZB8 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Zcchc2Q69ZB8 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Zcchc2Q69ZB8 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Zcchc2Q69ZB8 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Zcchc2Q69ZB8 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Zcchc2Q69ZB8 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Zcchc2Q69ZB8 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
Zcchc2Q69ZB8 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Zcchc2Q69ZB8 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Zcchc2Q69ZB8 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Zcchc2Q69ZB8 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Zcchc2Q69ZB8 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Zcchc2Q69ZB8 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Zcchc2Q69ZB8 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Zcchc2Q69ZB8 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Zcchc2Q69ZB8 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Zcchc2Q69ZB8 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Zcchc2Q69ZB8 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Zcchc2Q69ZB8 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Zcchc2Q69ZB8 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Zcchc2Q69ZB8 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Zcchc2Q69ZB8 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Zcchc2Q69ZB8 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Zcchc2Q69ZB8 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Zcchc2Q69ZB8 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Zcchc2Q69ZB8 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Zcchc2Q69ZB8 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Zcchc2Q69ZB8 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Zcchc2Q69ZB8 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Zcchc2Q69ZB8 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Zcchc2Q69ZB8 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Zcchc2Q69ZB8 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Zcchc2Q69ZB8 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Zcchc2Q69ZB8 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Zcchc2Q69ZB8 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Zcchc2Q69ZB8 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Zcchc2Q69ZB8 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Zcchc2Q69ZB8 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Zcchc2Q69ZB8 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Zcchc2Q69ZB8 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Zcchc2Q69ZB8 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Zcchc2Q69ZB8 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Zcchc2Q69ZB8 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Zcchc2Q69ZB8 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Zcchc2Q69ZB8 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Zcchc2Q69ZB8 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Zcchc2Q69ZB8 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Zcchc2Q69ZB8 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Zcchc2Q69ZB8 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Zcchc2Q69ZB8 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Zcchc2Q69ZB8 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Zcchc2Q69ZB8 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Zcchc2Q69ZB8 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18 ms