Protein–RNA interactions for Protein: Q68FH0

Pkp4, Plakophilin-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,190 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkp4Q68FH0 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Pkp4Q68FH0 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Pkp4Q68FH0 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Pkp4Q68FH0 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Pkp4Q68FH0 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Pkp4Q68FH0 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Pkp4Q68FH0 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Pkp4Q68FH0 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Pkp4Q68FH0 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Pkp4Q68FH0 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Pkp4Q68FH0 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Pkp4Q68FH0 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Pkp4Q68FH0 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Pkp4Q68FH0 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Pkp4Q68FH0 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Pkp4Q68FH0 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Pkp4Q68FH0 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Pkp4Q68FH0 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Pkp4Q68FH0 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Pkp4Q68FH0 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Pkp4Q68FH0 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Pkp4Q68FH0 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Pkp4Q68FH0 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Pkp4Q68FH0 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Pkp4Q68FH0 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Pkp4Q68FH0 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Pkp4Q68FH0 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Pkp4Q68FH0 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Pkp4Q68FH0 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Pkp4Q68FH0 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Pkp4Q68FH0 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Pkp4Q68FH0 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Pkp4Q68FH0 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Pkp4Q68FH0 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Pkp4Q68FH0 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Pkp4Q68FH0 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Pkp4Q68FH0 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Pkp4Q68FH0 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Pkp4Q68FH0 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Pkp4Q68FH0 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Pkp4Q68FH0 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Pkp4Q68FH0 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Pkp4Q68FH0 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Pkp4Q68FH0 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Pkp4Q68FH0 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Pkp4Q68FH0 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
Pkp4Q68FH0 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Pkp4Q68FH0 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Pkp4Q68FH0 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Pkp4Q68FH0 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Pkp4Q68FH0 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Pkp4Q68FH0 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Pkp4Q68FH0 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Pkp4Q68FH0 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Pkp4Q68FH0 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Pkp4Q68FH0 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Pkp4Q68FH0 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Pkp4Q68FH0 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Pkp4Q68FH0 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Pkp4Q68FH0 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Pkp4Q68FH0 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Pkp4Q68FH0 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Pkp4Q68FH0 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Pkp4Q68FH0 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Pkp4Q68FH0 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Pkp4Q68FH0 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Pkp4Q68FH0 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Pkp4Q68FH0 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Pkp4Q68FH0 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Pkp4Q68FH0 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Pkp4Q68FH0 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Pkp4Q68FH0 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Pkp4Q68FH0 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Pkp4Q68FH0 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Pkp4Q68FH0 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Pkp4Q68FH0 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Pkp4Q68FH0 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Pkp4Q68FH0 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Pkp4Q68FH0 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Pkp4Q68FH0 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Pkp4Q68FH0 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Pkp4Q68FH0 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Pkp4Q68FH0 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Pkp4Q68FH0 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Pkp4Q68FH0 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Pkp4Q68FH0 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Pkp4Q68FH0 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Pkp4Q68FH0 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Pkp4Q68FH0 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Pkp4Q68FH0 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Pkp4Q68FH0 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Pkp4Q68FH0 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Pkp4Q68FH0 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Pkp4Q68FH0 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Pkp4Q68FH0 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Pkp4Q68FH0 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Pkp4Q68FH0 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Pkp4Q68FH0 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Pkp4Q68FH0 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Pkp4Q68FH0 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms