Protein–RNA interactions for Protein: Q64291

Krt12, Keratin, type I cytoskeletal 12, mousemouse

Predictions only

Length 487 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt12Q64291 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Krt12Q64291 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Krt12Q64291 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Krt12Q64291 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Krt12Q64291 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Krt12Q64291 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Krt12Q64291 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Krt12Q64291 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Krt12Q64291 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Krt12Q64291 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Krt12Q64291 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Krt12Q64291 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Krt12Q64291 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Krt12Q64291 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Krt12Q64291 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Krt12Q64291 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Krt12Q64291 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Krt12Q64291 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Krt12Q64291 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Krt12Q64291 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Krt12Q64291 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Krt12Q64291 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Krt12Q64291 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Krt12Q64291 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Krt12Q64291 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Krt12Q64291 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Krt12Q64291 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Krt12Q64291 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Krt12Q64291 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Krt12Q64291 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Krt12Q64291 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Krt12Q64291 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Krt12Q64291 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Krt12Q64291 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Krt12Q64291 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Krt12Q64291 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Krt12Q64291 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Krt12Q64291 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Krt12Q64291 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Krt12Q64291 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Krt12Q64291 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Krt12Q64291 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Krt12Q64291 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Krt12Q64291 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Krt12Q64291 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Krt12Q64291 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Krt12Q64291 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Krt12Q64291 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Krt12Q64291 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Krt12Q64291 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Krt12Q64291 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Krt12Q64291 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Krt12Q64291 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Krt12Q64291 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Krt12Q64291 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Krt12Q64291 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Krt12Q64291 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Krt12Q64291 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Krt12Q64291 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Krt12Q64291 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Krt12Q64291 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Krt12Q64291 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Krt12Q64291 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Krt12Q64291 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Krt12Q64291 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Krt12Q64291 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Krt12Q64291 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Krt12Q64291 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Krt12Q64291 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Krt12Q64291 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Krt12Q64291 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Krt12Q64291 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Krt12Q64291 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Krt12Q64291 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Krt12Q64291 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Krt12Q64291 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Krt12Q64291 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Krt12Q64291 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Krt12Q64291 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Krt12Q64291 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Krt12Q64291 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Krt12Q64291 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Krt12Q64291 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Krt12Q64291 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Krt12Q64291 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Krt12Q64291 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.15
Krt12Q64291 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Krt12Q64291 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Krt12Q64291 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Krt12Q64291 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Krt12Q64291 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Krt12Q64291 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Krt12Q64291 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Krt12Q64291 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Krt12Q64291 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Krt12Q64291 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Krt12Q64291 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Krt12Q64291 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Krt12Q64291 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Krt12Q64291 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms