Protein–RNA interactions for Protein: Q63ZW6

Col4a5, Col4a5 protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,691 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col4a5Q63ZW6 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
Col4a5Q63ZW6 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
Col4a5Q63ZW6 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Col4a5Q63ZW6 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Col4a5Q63ZW6 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Col4a5Q63ZW6 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Col4a5Q63ZW6 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Col4a5Q63ZW6 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Col4a5Q63ZW6 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Col4a5Q63ZW6 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Col4a5Q63ZW6 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Col4a5Q63ZW6 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Col4a5Q63ZW6 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Col4a5Q63ZW6 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Col4a5Q63ZW6 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Col4a5Q63ZW6 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Col4a5Q63ZW6 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Col4a5Q63ZW6 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Col4a5Q63ZW6 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
Col4a5Q63ZW6 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Col4a5Q63ZW6 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Col4a5Q63ZW6 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
Col4a5Q63ZW6 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Col4a5Q63ZW6 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Col4a5Q63ZW6 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Col4a5Q63ZW6 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
Col4a5Q63ZW6 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Col4a5Q63ZW6 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Col4a5Q63ZW6 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Col4a5Q63ZW6 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Col4a5Q63ZW6 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Col4a5Q63ZW6 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Col4a5Q63ZW6 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
Col4a5Q63ZW6 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Col4a5Q63ZW6 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Col4a5Q63ZW6 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Col4a5Q63ZW6 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Col4a5Q63ZW6 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Col4a5Q63ZW6 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Col4a5Q63ZW6 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Col4a5Q63ZW6 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Col4a5Q63ZW6 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
Col4a5Q63ZW6 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Col4a5Q63ZW6 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Col4a5Q63ZW6 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Col4a5Q63ZW6 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Col4a5Q63ZW6 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
Col4a5Q63ZW6 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Col4a5Q63ZW6 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
Col4a5Q63ZW6 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Col4a5Q63ZW6 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Col4a5Q63ZW6 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Col4a5Q63ZW6 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Col4a5Q63ZW6 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Col4a5Q63ZW6 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Col4a5Q63ZW6 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Col4a5Q63ZW6 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Col4a5Q63ZW6 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Col4a5Q63ZW6 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
Col4a5Q63ZW6 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Col4a5Q63ZW6 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Col4a5Q63ZW6 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Col4a5Q63ZW6 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Col4a5Q63ZW6 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Col4a5Q63ZW6 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Col4a5Q63ZW6 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
Col4a5Q63ZW6 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Col4a5Q63ZW6 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Col4a5Q63ZW6 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Col4a5Q63ZW6 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Col4a5Q63ZW6 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Col4a5Q63ZW6 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Col4a5Q63ZW6 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Col4a5Q63ZW6 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Col4a5Q63ZW6 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Col4a5Q63ZW6 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Col4a5Q63ZW6 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Col4a5Q63ZW6 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Col4a5Q63ZW6 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Col4a5Q63ZW6 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Col4a5Q63ZW6 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Col4a5Q63ZW6 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Col4a5Q63ZW6 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
Col4a5Q63ZW6 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Col4a5Q63ZW6 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Col4a5Q63ZW6 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Col4a5Q63ZW6 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Col4a5Q63ZW6 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Col4a5Q63ZW6 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Col4a5Q63ZW6 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Col4a5Q63ZW6 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Col4a5Q63ZW6 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Col4a5Q63ZW6 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Col4a5Q63ZW6 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Col4a5Q63ZW6 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Col4a5Q63ZW6 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Col4a5Q63ZW6 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Col4a5Q63ZW6 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
Col4a5Q63ZW6 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Col4a5Q63ZW6 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.6 ms