Protein–RNA interactions for Protein: Q62481

Vps72, Vacuolar protein sorting-associated protein 72 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 368 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps72Q62481 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Vps72Q62481 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Vps72Q62481 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Vps72Q62481 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Vps72Q62481 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Vps72Q62481 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Vps72Q62481 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Vps72Q62481 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Vps72Q62481 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Vps72Q62481 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Vps72Q62481 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Vps72Q62481 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Vps72Q62481 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Vps72Q62481 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Vps72Q62481 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Vps72Q62481 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Vps72Q62481 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Vps72Q62481 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Vps72Q62481 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Vps72Q62481 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Vps72Q62481 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Vps72Q62481 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Vps72Q62481 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Vps72Q62481 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Vps72Q62481 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Vps72Q62481 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Vps72Q62481 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Vps72Q62481 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Vps72Q62481 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Vps72Q62481 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Vps72Q62481 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Vps72Q62481 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Vps72Q62481 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Vps72Q62481 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Vps72Q62481 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Vps72Q62481 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Vps72Q62481 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Vps72Q62481 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Vps72Q62481 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Vps72Q62481 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Vps72Q62481 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Vps72Q62481 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Vps72Q62481 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Vps72Q62481 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Vps72Q62481 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Vps72Q62481 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Vps72Q62481 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Vps72Q62481 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Vps72Q62481 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Vps72Q62481 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Vps72Q62481 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Vps72Q62481 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Vps72Q62481 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Vps72Q62481 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Vps72Q62481 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Vps72Q62481 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Vps72Q62481 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Vps72Q62481 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Vps72Q62481 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Vps72Q62481 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Vps72Q62481 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Vps72Q62481 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Vps72Q62481 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Vps72Q62481 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Vps72Q62481 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Vps72Q62481 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Vps72Q62481 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Vps72Q62481 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Vps72Q62481 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Vps72Q62481 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Vps72Q62481 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Vps72Q62481 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Vps72Q62481 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Vps72Q62481 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Vps72Q62481 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Vps72Q62481 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Vps72Q62481 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Vps72Q62481 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Vps72Q62481 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Vps72Q62481 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Vps72Q62481 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Vps72Q62481 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Vps72Q62481 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Vps72Q62481 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Vps72Q62481 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Vps72Q62481 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Vps72Q62481 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Vps72Q62481 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Vps72Q62481 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Vps72Q62481 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Vps72Q62481 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Vps72Q62481 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Vps72Q62481 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Vps72Q62481 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Vps72Q62481 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Vps72Q62481 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Vps72Q62481 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Vps72Q62481 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Vps72Q62481 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Vps72Q62481 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.7 ms