Protein–RNA interactions for Protein: Q62442

Vamp1, Vesicle-associated membrane protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vamp1Q62442 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Vamp1Q62442 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Vamp1Q62442 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Vamp1Q62442 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Vamp1Q62442 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Vamp1Q62442 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Vamp1Q62442 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Vamp1Q62442 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Vamp1Q62442 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Vamp1Q62442 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Vamp1Q62442 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Vamp1Q62442 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Vamp1Q62442 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Vamp1Q62442 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Vamp1Q62442 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Vamp1Q62442 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Vamp1Q62442 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Vamp1Q62442 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Vamp1Q62442 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Vamp1Q62442 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Vamp1Q62442 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Vamp1Q62442 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Vamp1Q62442 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Vamp1Q62442 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Vamp1Q62442 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Vamp1Q62442 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Vamp1Q62442 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Vamp1Q62442 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Vamp1Q62442 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Vamp1Q62442 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Vamp1Q62442 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Vamp1Q62442 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Vamp1Q62442 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Vamp1Q62442 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Vamp1Q62442 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Vamp1Q62442 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Vamp1Q62442 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Vamp1Q62442 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Vamp1Q62442 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Vamp1Q62442 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Vamp1Q62442 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Vamp1Q62442 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Vamp1Q62442 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Vamp1Q62442 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Vamp1Q62442 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Vamp1Q62442 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Vamp1Q62442 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Vamp1Q62442 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Vamp1Q62442 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Vamp1Q62442 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Vamp1Q62442 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Vamp1Q62442 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Vamp1Q62442 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Vamp1Q62442 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Vamp1Q62442 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Vamp1Q62442 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Vamp1Q62442 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Vamp1Q62442 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Vamp1Q62442 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Vamp1Q62442 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Vamp1Q62442 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Vamp1Q62442 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Vamp1Q62442 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Vamp1Q62442 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Vamp1Q62442 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Vamp1Q62442 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Vamp1Q62442 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Vamp1Q62442 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Vamp1Q62442 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Vamp1Q62442 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Vamp1Q62442 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Vamp1Q62442 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Vamp1Q62442 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Vamp1Q62442 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Vamp1Q62442 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Vamp1Q62442 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Vamp1Q62442 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Vamp1Q62442 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Vamp1Q62442 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Vamp1Q62442 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Vamp1Q62442 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Vamp1Q62442 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Vamp1Q62442 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Vamp1Q62442 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Vamp1Q62442 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Vamp1Q62442 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Vamp1Q62442 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Vamp1Q62442 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Vamp1Q62442 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Vamp1Q62442 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Vamp1Q62442 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Vamp1Q62442 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Vamp1Q62442 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Vamp1Q62442 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Vamp1Q62442 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Vamp1Q62442 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Vamp1Q62442 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Vamp1Q62442 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Vamp1Q62442 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Vamp1Q62442 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.3 ms