Protein–RNA interactions for Protein: Q62361

Trh, Pro-thyrotropin-releasing hormone, mousemouse

Predictions only

Length 256 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TrhQ62361 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
TrhQ62361 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
TrhQ62361 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
TrhQ62361 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
TrhQ62361 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
TrhQ62361 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
TrhQ62361 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
TrhQ62361 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
TrhQ62361 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
TrhQ62361 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
TrhQ62361 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
TrhQ62361 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
TrhQ62361 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
TrhQ62361 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC26.65■■□□□ 1.86
TrhQ62361 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
TrhQ62361 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
TrhQ62361 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
TrhQ62361 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
TrhQ62361 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.86
TrhQ62361 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
TrhQ62361 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
TrhQ62361 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
TrhQ62361 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
TrhQ62361 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
TrhQ62361 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
TrhQ62361 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
TrhQ62361 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
TrhQ62361 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC26.63■■□□□ 1.85
TrhQ62361 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
TrhQ62361 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
TrhQ62361 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
TrhQ62361 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
TrhQ62361 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
TrhQ62361 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
TrhQ62361 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
TrhQ62361 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
TrhQ62361 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
TrhQ62361 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
TrhQ62361 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
TrhQ62361 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
TrhQ62361 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
TrhQ62361 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
TrhQ62361 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
TrhQ62361 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
TrhQ62361 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
TrhQ62361 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
TrhQ62361 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
TrhQ62361 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
TrhQ62361 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
TrhQ62361 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
TrhQ62361 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
TrhQ62361 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
TrhQ62361 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
TrhQ62361 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
TrhQ62361 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
TrhQ62361 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
TrhQ62361 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
TrhQ62361 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
TrhQ62361 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
TrhQ62361 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
TrhQ62361 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
TrhQ62361 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
TrhQ62361 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC26.57■■□□□ 1.84
TrhQ62361 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
TrhQ62361 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
TrhQ62361 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
TrhQ62361 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
TrhQ62361 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
TrhQ62361 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
TrhQ62361 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
TrhQ62361 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
TrhQ62361 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
TrhQ62361 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
TrhQ62361 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
TrhQ62361 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
TrhQ62361 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
TrhQ62361 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
TrhQ62361 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
TrhQ62361 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
TrhQ62361 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
TrhQ62361 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
TrhQ62361 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
TrhQ62361 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
TrhQ62361 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
TrhQ62361 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
TrhQ62361 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
TrhQ62361 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
TrhQ62361 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
TrhQ62361 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
TrhQ62361 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
TrhQ62361 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
TrhQ62361 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
TrhQ62361 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
TrhQ62361 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
TrhQ62361 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
TrhQ62361 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
TrhQ62361 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
TrhQ62361 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
TrhQ62361 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
TrhQ62361 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 109.1 ms