Protein–RNA interactions for Protein: Q62209

Sycp1, Synaptonemal complex protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 993 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sycp1Q62209 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Sycp1Q62209 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Sycp1Q62209 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
Sycp1Q62209 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Sycp1Q62209 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Sycp1Q62209 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Sycp1Q62209 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Sycp1Q62209 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Sycp1Q62209 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Sycp1Q62209 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
Sycp1Q62209 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Sycp1Q62209 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Sycp1Q62209 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Sycp1Q62209 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Sycp1Q62209 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Sycp1Q62209 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Sycp1Q62209 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Sycp1Q62209 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Sycp1Q62209 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Sycp1Q62209 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Sycp1Q62209 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Sycp1Q62209 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Sycp1Q62209 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Sycp1Q62209 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Sycp1Q62209 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Sycp1Q62209 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Sycp1Q62209 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Sycp1Q62209 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Sycp1Q62209 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Sycp1Q62209 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Sycp1Q62209 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Sycp1Q62209 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Sycp1Q62209 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Sycp1Q62209 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Sycp1Q62209 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Sycp1Q62209 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Sycp1Q62209 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Sycp1Q62209 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Sycp1Q62209 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Sycp1Q62209 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Sycp1Q62209 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Sycp1Q62209 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Sycp1Q62209 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Sycp1Q62209 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Sycp1Q62209 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Sycp1Q62209 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Sycp1Q62209 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Sycp1Q62209 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Sycp1Q62209 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Sycp1Q62209 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Sycp1Q62209 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Sycp1Q62209 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Sycp1Q62209 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Sycp1Q62209 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Sycp1Q62209 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Sycp1Q62209 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Sycp1Q62209 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Sycp1Q62209 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Sycp1Q62209 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Sycp1Q62209 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Sycp1Q62209 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Sycp1Q62209 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Sycp1Q62209 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Sycp1Q62209 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Sycp1Q62209 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Sycp1Q62209 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Sycp1Q62209 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Sycp1Q62209 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Sycp1Q62209 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Sycp1Q62209 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Sycp1Q62209 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Sycp1Q62209 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Sycp1Q62209 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Sycp1Q62209 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Sycp1Q62209 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Sycp1Q62209 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Sycp1Q62209 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Sycp1Q62209 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Sycp1Q62209 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Sycp1Q62209 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Sycp1Q62209 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Sycp1Q62209 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Sycp1Q62209 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
Sycp1Q62209 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Sycp1Q62209 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Sycp1Q62209 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Sycp1Q62209 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Sycp1Q62209 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Sycp1Q62209 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Sycp1Q62209 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Sycp1Q62209 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Sycp1Q62209 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Sycp1Q62209 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Sycp1Q62209 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Sycp1Q62209 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Sycp1Q62209 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Sycp1Q62209 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Sycp1Q62209 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Sycp1Q62209 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Sycp1Q62209 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms