Protein–RNA interactions for Protein: Q62018

Ctr9, RNA polymerase-associated protein CTR9 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctr9Q62018 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ctr9Q62018 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ctr9Q62018 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ctr9Q62018 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ctr9Q62018 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ctr9Q62018 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ctr9Q62018 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Ctr9Q62018 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Ctr9Q62018 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Ctr9Q62018 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Ctr9Q62018 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Ctr9Q62018 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Ctr9Q62018 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Ctr9Q62018 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
Ctr9Q62018 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ctr9Q62018 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ctr9Q62018 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ctr9Q62018 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ctr9Q62018 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ctr9Q62018 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ctr9Q62018 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ctr9Q62018 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ctr9Q62018 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ctr9Q62018 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ctr9Q62018 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ctr9Q62018 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ctr9Q62018 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ctr9Q62018 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ctr9Q62018 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ctr9Q62018 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ctr9Q62018 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ctr9Q62018 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ctr9Q62018 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ctr9Q62018 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ctr9Q62018 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ctr9Q62018 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ctr9Q62018 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ctr9Q62018 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ctr9Q62018 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ctr9Q62018 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ctr9Q62018 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ctr9Q62018 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
Ctr9Q62018 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ctr9Q62018 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ctr9Q62018 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ctr9Q62018 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ctr9Q62018 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ctr9Q62018 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ctr9Q62018 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ctr9Q62018 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ctr9Q62018 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
Ctr9Q62018 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ctr9Q62018 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ctr9Q62018 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ctr9Q62018 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ctr9Q62018 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ctr9Q62018 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
Ctr9Q62018 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
Ctr9Q62018 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ctr9Q62018 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ctr9Q62018 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ctr9Q62018 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ctr9Q62018 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ctr9Q62018 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ctr9Q62018 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ctr9Q62018 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ctr9Q62018 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ctr9Q62018 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ctr9Q62018 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ctr9Q62018 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ctr9Q62018 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ctr9Q62018 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ctr9Q62018 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ctr9Q62018 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
Ctr9Q62018 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ctr9Q62018 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ctr9Q62018 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ctr9Q62018 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ctr9Q62018 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ctr9Q62018 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ctr9Q62018 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ctr9Q62018 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ctr9Q62018 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ctr9Q62018 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ctr9Q62018 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ctr9Q62018 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ctr9Q62018 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ctr9Q62018 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ctr9Q62018 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ctr9Q62018 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ctr9Q62018 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
Ctr9Q62018 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ctr9Q62018 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ctr9Q62018 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Ctr9Q62018 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Ctr9Q62018 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Ctr9Q62018 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Ctr9Q62018 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Ctr9Q62018 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Ctr9Q62018 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.1 ms