Protein–RNA interactions for Protein: Q61474

Msi1, RNA-binding protein Musashi homolog 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 362 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msi1Q61474 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Msi1Q61474 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Msi1Q61474 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Msi1Q61474 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Msi1Q61474 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Msi1Q61474 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Msi1Q61474 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Msi1Q61474 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Msi1Q61474 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Msi1Q61474 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Msi1Q61474 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Msi1Q61474 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Msi1Q61474 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Msi1Q61474 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Msi1Q61474 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Msi1Q61474 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Msi1Q61474 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Msi1Q61474 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Msi1Q61474 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Msi1Q61474 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Msi1Q61474 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Msi1Q61474 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Msi1Q61474 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Msi1Q61474 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Msi1Q61474 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Msi1Q61474 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Msi1Q61474 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Msi1Q61474 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Msi1Q61474 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Msi1Q61474 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Msi1Q61474 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Msi1Q61474 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Msi1Q61474 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Msi1Q61474 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Msi1Q61474 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Msi1Q61474 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Msi1Q61474 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Msi1Q61474 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Msi1Q61474 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Msi1Q61474 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Msi1Q61474 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Msi1Q61474 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Msi1Q61474 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Msi1Q61474 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Msi1Q61474 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Msi1Q61474 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Msi1Q61474 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Msi1Q61474 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Msi1Q61474 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Msi1Q61474 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Msi1Q61474 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Msi1Q61474 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Msi1Q61474 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Msi1Q61474 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Msi1Q61474 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Msi1Q61474 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Msi1Q61474 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Msi1Q61474 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Msi1Q61474 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Msi1Q61474 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Msi1Q61474 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Msi1Q61474 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Msi1Q61474 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Msi1Q61474 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Msi1Q61474 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Msi1Q61474 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Msi1Q61474 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Msi1Q61474 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Msi1Q61474 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Msi1Q61474 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
Msi1Q61474 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Msi1Q61474 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Msi1Q61474 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Msi1Q61474 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Msi1Q61474 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Msi1Q61474 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Msi1Q61474 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Msi1Q61474 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Msi1Q61474 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Msi1Q61474 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Msi1Q61474 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Msi1Q61474 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Msi1Q61474 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Msi1Q61474 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Msi1Q61474 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Msi1Q61474 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Msi1Q61474 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Msi1Q61474 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Msi1Q61474 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Msi1Q61474 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Msi1Q61474 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Msi1Q61474 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Msi1Q61474 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Msi1Q61474 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Msi1Q61474 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Msi1Q61474 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Msi1Q61474 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Msi1Q61474 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Msi1Q61474 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Msi1Q61474 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms