Protein–RNA interactions for Protein: Q61187

Tsg101, Tumor susceptibility gene 101 protein, mousemouse

Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tsg101Q61187 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Tsg101Q61187 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Tsg101Q61187 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Tsg101Q61187 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Tsg101Q61187 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Tsg101Q61187 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Tsg101Q61187 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Tsg101Q61187 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Tsg101Q61187 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Tsg101Q61187 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Tsg101Q61187 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Tsg101Q61187 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Tsg101Q61187 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Tsg101Q61187 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Tsg101Q61187 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Tsg101Q61187 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Tsg101Q61187 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Tsg101Q61187 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Tsg101Q61187 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Tsg101Q61187 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
Tsg101Q61187 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Tsg101Q61187 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Tsg101Q61187 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Tsg101Q61187 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Tsg101Q61187 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Tsg101Q61187 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Tsg101Q61187 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Tsg101Q61187 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Tsg101Q61187 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Tsg101Q61187 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Tsg101Q61187 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Tsg101Q61187 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Tsg101Q61187 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Tsg101Q61187 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Tsg101Q61187 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Tsg101Q61187 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Tsg101Q61187 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Tsg101Q61187 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Tsg101Q61187 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Tsg101Q61187 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Tsg101Q61187 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Tsg101Q61187 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Tsg101Q61187 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Tsg101Q61187 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Tsg101Q61187 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Tsg101Q61187 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Tsg101Q61187 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Tsg101Q61187 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Tsg101Q61187 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Tsg101Q61187 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Tsg101Q61187 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Tsg101Q61187 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Tsg101Q61187 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Tsg101Q61187 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Tsg101Q61187 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Tsg101Q61187 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Tsg101Q61187 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Tsg101Q61187 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Tsg101Q61187 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Tsg101Q61187 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Tsg101Q61187 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Tsg101Q61187 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Tsg101Q61187 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Tsg101Q61187 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Tsg101Q61187 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Tsg101Q61187 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Tsg101Q61187 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Tsg101Q61187 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Tsg101Q61187 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Tsg101Q61187 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Tsg101Q61187 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Tsg101Q61187 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Tsg101Q61187 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Tsg101Q61187 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Tsg101Q61187 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Tsg101Q61187 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Tsg101Q61187 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Tsg101Q61187 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Tsg101Q61187 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Tsg101Q61187 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Tsg101Q61187 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Tsg101Q61187 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Tsg101Q61187 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Tsg101Q61187 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Tsg101Q61187 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Tsg101Q61187 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Tsg101Q61187 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Tsg101Q61187 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Tsg101Q61187 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Tsg101Q61187 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Tsg101Q61187 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Tsg101Q61187 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Tsg101Q61187 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Tsg101Q61187 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Tsg101Q61187 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Tsg101Q61187 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Tsg101Q61187 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Tsg101Q61187 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Tsg101Q61187 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Tsg101Q61187 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.1 ms