Protein–RNA interactions for Protein: Q60976

Jrk, Jerky protein, mousemouse

Predictions only

Length 557 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
JrkQ60976 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
JrkQ60976 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
JrkQ60976 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
JrkQ60976 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
JrkQ60976 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
JrkQ60976 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
JrkQ60976 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
JrkQ60976 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
JrkQ60976 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
JrkQ60976 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
JrkQ60976 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
JrkQ60976 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
JrkQ60976 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
JrkQ60976 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
JrkQ60976 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
JrkQ60976 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
JrkQ60976 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
JrkQ60976 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
JrkQ60976 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
JrkQ60976 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
JrkQ60976 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
JrkQ60976 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
JrkQ60976 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
JrkQ60976 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
JrkQ60976 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
JrkQ60976 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
JrkQ60976 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
JrkQ60976 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
JrkQ60976 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
JrkQ60976 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
JrkQ60976 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
JrkQ60976 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
JrkQ60976 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
JrkQ60976 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
JrkQ60976 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
JrkQ60976 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
JrkQ60976 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
JrkQ60976 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
JrkQ60976 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
JrkQ60976 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
JrkQ60976 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
JrkQ60976 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
JrkQ60976 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
JrkQ60976 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
JrkQ60976 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
JrkQ60976 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
JrkQ60976 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC21■□□□□ 0.95
JrkQ60976 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
JrkQ60976 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
JrkQ60976 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
JrkQ60976 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
JrkQ60976 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
JrkQ60976 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
JrkQ60976 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
JrkQ60976 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
JrkQ60976 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
JrkQ60976 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
JrkQ60976 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
JrkQ60976 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
JrkQ60976 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
JrkQ60976 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
JrkQ60976 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC20.97■□□□□ 0.95
JrkQ60976 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
JrkQ60976 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
JrkQ60976 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
JrkQ60976 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
JrkQ60976 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
JrkQ60976 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
JrkQ60976 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
JrkQ60976 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
JrkQ60976 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
JrkQ60976 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
JrkQ60976 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
JrkQ60976 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
JrkQ60976 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
JrkQ60976 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
JrkQ60976 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
JrkQ60976 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
JrkQ60976 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
JrkQ60976 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
JrkQ60976 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
JrkQ60976 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
JrkQ60976 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
JrkQ60976 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
JrkQ60976 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
JrkQ60976 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
JrkQ60976 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
JrkQ60976 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
JrkQ60976 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
JrkQ60976 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
JrkQ60976 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
JrkQ60976 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
JrkQ60976 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC20.93■□□□□ 0.94
JrkQ60976 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
JrkQ60976 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
JrkQ60976 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
JrkQ60976 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
JrkQ60976 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
JrkQ60976 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
JrkQ60976 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.8 ms