Protein–RNA interactions for Protein: Q60688

Foxd4, Forkhead box protein D4, mousemouse

Predictions only

Length 444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxd4Q60688 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Foxd4Q60688 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Foxd4Q60688 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Foxd4Q60688 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Foxd4Q60688 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Foxd4Q60688 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Foxd4Q60688 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Foxd4Q60688 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Foxd4Q60688 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Foxd4Q60688 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Foxd4Q60688 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Foxd4Q60688 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Foxd4Q60688 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Foxd4Q60688 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Foxd4Q60688 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Foxd4Q60688 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.07
Foxd4Q60688 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Foxd4Q60688 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Foxd4Q60688 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Foxd4Q60688 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Foxd4Q60688 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Foxd4Q60688 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Foxd4Q60688 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Foxd4Q60688 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Foxd4Q60688 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Foxd4Q60688 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Foxd4Q60688 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Foxd4Q60688 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Foxd4Q60688 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Foxd4Q60688 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Foxd4Q60688 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Foxd4Q60688 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Foxd4Q60688 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Foxd4Q60688 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Foxd4Q60688 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Foxd4Q60688 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Foxd4Q60688 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Foxd4Q60688 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Foxd4Q60688 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Foxd4Q60688 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Foxd4Q60688 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Foxd4Q60688 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Foxd4Q60688 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Foxd4Q60688 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Foxd4Q60688 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Foxd4Q60688 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Foxd4Q60688 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Foxd4Q60688 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Foxd4Q60688 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Foxd4Q60688 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Foxd4Q60688 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Foxd4Q60688 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Foxd4Q60688 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Foxd4Q60688 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Foxd4Q60688 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Foxd4Q60688 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Foxd4Q60688 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Foxd4Q60688 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Foxd4Q60688 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
Foxd4Q60688 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Foxd4Q60688 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Foxd4Q60688 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Foxd4Q60688 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Foxd4Q60688 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Foxd4Q60688 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Foxd4Q60688 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Foxd4Q60688 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Foxd4Q60688 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Foxd4Q60688 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Foxd4Q60688 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Foxd4Q60688 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Foxd4Q60688 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Foxd4Q60688 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Foxd4Q60688 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Foxd4Q60688 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Foxd4Q60688 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Foxd4Q60688 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Foxd4Q60688 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Foxd4Q60688 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Foxd4Q60688 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Foxd4Q60688 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Foxd4Q60688 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Foxd4Q60688 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Foxd4Q60688 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Foxd4Q60688 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Foxd4Q60688 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Foxd4Q60688 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Foxd4Q60688 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Foxd4Q60688 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Foxd4Q60688 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Foxd4Q60688 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Foxd4Q60688 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Foxd4Q60688 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Foxd4Q60688 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Foxd4Q60688 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Foxd4Q60688 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Foxd4Q60688 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Foxd4Q60688 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Foxd4Q60688 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Foxd4Q60688 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 144 ms