Protein–RNA interactions for Protein: Q60670

Sik1, Serine/threonine-protein kinase SIK1, mousemouse

Predictions only

Length 779 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sik1Q60670 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Sik1Q60670 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Sik1Q60670 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
Sik1Q60670 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Sik1Q60670 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Sik1Q60670 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
Sik1Q60670 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Sik1Q60670 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Sik1Q60670 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Sik1Q60670 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
Sik1Q60670 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Sik1Q60670 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Sik1Q60670 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.05
Sik1Q60670 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.05
Sik1Q60670 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
Sik1Q60670 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
Sik1Q60670 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Sik1Q60670 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Sik1Q60670 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Sik1Q60670 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Sik1Q60670 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Sik1Q60670 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Sik1Q60670 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Sik1Q60670 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Sik1Q60670 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Sik1Q60670 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
Sik1Q60670 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Sik1Q60670 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Sik1Q60670 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Sik1Q60670 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Sik1Q60670 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Sik1Q60670 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Sik1Q60670 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Sik1Q60670 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Sik1Q60670 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Sik1Q60670 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Sik1Q60670 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Sik1Q60670 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Sik1Q60670 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Sik1Q60670 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Sik1Q60670 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Sik1Q60670 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Sik1Q60670 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Sik1Q60670 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Sik1Q60670 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Sik1Q60670 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Sik1Q60670 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Sik1Q60670 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Sik1Q60670 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Sik1Q60670 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Sik1Q60670 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Sik1Q60670 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Sik1Q60670 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Sik1Q60670 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Sik1Q60670 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
Sik1Q60670 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Sik1Q60670 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Sik1Q60670 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Sik1Q60670 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Sik1Q60670 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Sik1Q60670 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Sik1Q60670 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Sik1Q60670 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Sik1Q60670 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Sik1Q60670 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Sik1Q60670 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Sik1Q60670 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Sik1Q60670 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Sik1Q60670 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Sik1Q60670 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Sik1Q60670 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Sik1Q60670 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Sik1Q60670 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Sik1Q60670 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Sik1Q60670 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Sik1Q60670 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Sik1Q60670 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Sik1Q60670 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
Sik1Q60670 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
Sik1Q60670 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
Sik1Q60670 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Sik1Q60670 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Sik1Q60670 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Sik1Q60670 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Sik1Q60670 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Sik1Q60670 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Sik1Q60670 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Sik1Q60670 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Sik1Q60670 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Sik1Q60670 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Sik1Q60670 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Sik1Q60670 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Sik1Q60670 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Sik1Q60670 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Sik1Q60670 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Sik1Q60670 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Sik1Q60670 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Sik1Q60670 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
Sik1Q60670 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Sik1Q60670 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.5 ms