Protein–RNA interactions for Protein: Q60520

Sin3a, Paired amphipathic helix protein Sin3a, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,274 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sin3aQ60520 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC30.02■■■□□ 2.4
Sin3aQ60520 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
Sin3aQ60520 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
Sin3aQ60520 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.4
Sin3aQ60520 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
Sin3aQ60520 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
Sin3aQ60520 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
Sin3aQ60520 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
Sin3aQ60520 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC30■■■□□ 2.39
Sin3aQ60520 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
Sin3aQ60520 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
Sin3aQ60520 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30■■■□□ 2.39
Sin3aQ60520 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
Sin3aQ60520 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
Sin3aQ60520 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
Sin3aQ60520 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
Sin3aQ60520 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
Sin3aQ60520 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
Sin3aQ60520 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
Sin3aQ60520 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC29.98■■■□□ 2.39
Sin3aQ60520 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
Sin3aQ60520 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
Sin3aQ60520 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
Sin3aQ60520 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC29.96■■■□□ 2.39
Sin3aQ60520 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
Sin3aQ60520 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
Sin3aQ60520 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC29.96■■■□□ 2.39
Sin3aQ60520 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
Sin3aQ60520 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
Sin3aQ60520 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
Sin3aQ60520 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC29.94■■■□□ 2.38
Sin3aQ60520 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
Sin3aQ60520 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
Sin3aQ60520 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
Sin3aQ60520 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC29.93■■■□□ 2.38
Sin3aQ60520 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
Sin3aQ60520 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
Sin3aQ60520 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.92■■■□□ 2.38
Sin3aQ60520 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
Sin3aQ60520 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
Sin3aQ60520 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
Sin3aQ60520 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
Sin3aQ60520 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
Sin3aQ60520 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
Sin3aQ60520 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
Sin3aQ60520 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC29.9■■■□□ 2.38
Sin3aQ60520 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
Sin3aQ60520 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
Sin3aQ60520 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC29.9■■■□□ 2.38
Sin3aQ60520 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC29.9■■■□□ 2.38
Sin3aQ60520 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC29.9■■■□□ 2.38
Sin3aQ60520 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
Sin3aQ60520 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
Sin3aQ60520 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
Sin3aQ60520 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.89■■■□□ 2.38
Sin3aQ60520 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.38
Sin3aQ60520 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
Sin3aQ60520 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.37
Sin3aQ60520 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.37
Sin3aQ60520 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC29.88■■■□□ 2.37
Sin3aQ60520 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC29.88■■■□□ 2.37
Sin3aQ60520 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
Sin3aQ60520 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
Sin3aQ60520 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
Sin3aQ60520 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
Sin3aQ60520 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
Sin3aQ60520 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
Sin3aQ60520 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
Sin3aQ60520 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
Sin3aQ60520 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
Sin3aQ60520 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC29.85■■■□□ 2.37
Sin3aQ60520 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC29.85■■■□□ 2.37
Sin3aQ60520 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
Sin3aQ60520 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
Sin3aQ60520 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
Sin3aQ60520 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
Sin3aQ60520 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
Sin3aQ60520 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
Sin3aQ60520 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
Sin3aQ60520 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
Sin3aQ60520 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC29.84■■■□□ 2.37
Sin3aQ60520 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
Sin3aQ60520 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
Sin3aQ60520 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.84■■■□□ 2.37
Sin3aQ60520 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
Sin3aQ60520 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
Sin3aQ60520 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
Sin3aQ60520 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC29.83■■■□□ 2.37
Sin3aQ60520 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
Sin3aQ60520 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
Sin3aQ60520 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
Sin3aQ60520 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
Sin3aQ60520 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
Sin3aQ60520 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
Sin3aQ60520 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
Sin3aQ60520 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC29.81■■■□□ 2.36
Sin3aQ60520 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
Sin3aQ60520 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
Sin3aQ60520 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
Sin3aQ60520 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.8 ms