Protein–RNA interactions for Protein: Q5U4D8

Slc5a6, Sodium-dependent multivitamin transporter, mousemouse

Predictions only

Length 634 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc5a6Q5U4D8 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Slc5a6Q5U4D8 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Slc5a6Q5U4D8 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Slc5a6Q5U4D8 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Slc5a6Q5U4D8 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Slc5a6Q5U4D8 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Slc5a6Q5U4D8 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Slc5a6Q5U4D8 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Slc5a6Q5U4D8 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Slc5a6Q5U4D8 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Slc5a6Q5U4D8 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Slc5a6Q5U4D8 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Slc5a6Q5U4D8 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Slc5a6Q5U4D8 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Slc5a6Q5U4D8 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Slc5a6Q5U4D8 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Slc5a6Q5U4D8 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Slc5a6Q5U4D8 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Slc5a6Q5U4D8 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Slc5a6Q5U4D8 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Slc5a6Q5U4D8 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Slc5a6Q5U4D8 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Slc5a6Q5U4D8 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Slc5a6Q5U4D8 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Slc5a6Q5U4D8 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Slc5a6Q5U4D8 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
Slc5a6Q5U4D8 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Slc5a6Q5U4D8 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Slc5a6Q5U4D8 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
Slc5a6Q5U4D8 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Slc5a6Q5U4D8 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Slc5a6Q5U4D8 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Slc5a6Q5U4D8 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Slc5a6Q5U4D8 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Slc5a6Q5U4D8 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Slc5a6Q5U4D8 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Slc5a6Q5U4D8 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Slc5a6Q5U4D8 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Slc5a6Q5U4D8 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Slc5a6Q5U4D8 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Slc5a6Q5U4D8 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Slc5a6Q5U4D8 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Slc5a6Q5U4D8 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Slc5a6Q5U4D8 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Slc5a6Q5U4D8 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Slc5a6Q5U4D8 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Slc5a6Q5U4D8 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Slc5a6Q5U4D8 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Slc5a6Q5U4D8 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Slc5a6Q5U4D8 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Slc5a6Q5U4D8 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Slc5a6Q5U4D8 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Slc5a6Q5U4D8 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Slc5a6Q5U4D8 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Slc5a6Q5U4D8 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Slc5a6Q5U4D8 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Slc5a6Q5U4D8 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Slc5a6Q5U4D8 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Slc5a6Q5U4D8 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Slc5a6Q5U4D8 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Slc5a6Q5U4D8 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Slc5a6Q5U4D8 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Slc5a6Q5U4D8 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Slc5a6Q5U4D8 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Slc5a6Q5U4D8 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Slc5a6Q5U4D8 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Slc5a6Q5U4D8 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Slc5a6Q5U4D8 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Slc5a6Q5U4D8 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Slc5a6Q5U4D8 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Slc5a6Q5U4D8 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Slc5a6Q5U4D8 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Slc5a6Q5U4D8 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Slc5a6Q5U4D8 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Slc5a6Q5U4D8 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
Slc5a6Q5U4D8 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Slc5a6Q5U4D8 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Slc5a6Q5U4D8 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Slc5a6Q5U4D8 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Slc5a6Q5U4D8 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Slc5a6Q5U4D8 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Slc5a6Q5U4D8 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Slc5a6Q5U4D8 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Slc5a6Q5U4D8 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Slc5a6Q5U4D8 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Slc5a6Q5U4D8 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Slc5a6Q5U4D8 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Slc5a6Q5U4D8 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Slc5a6Q5U4D8 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Slc5a6Q5U4D8 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Slc5a6Q5U4D8 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Slc5a6Q5U4D8 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Slc5a6Q5U4D8 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Slc5a6Q5U4D8 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Slc5a6Q5U4D8 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Slc5a6Q5U4D8 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Slc5a6Q5U4D8 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Slc5a6Q5U4D8 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Slc5a6Q5U4D8 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Slc5a6Q5U4D8 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 97.8 ms