Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSN7

Sft2d1, Vesicle transport protein SFT2A, mousemouse

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sft2d1Q5SSN7 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Sft2d1Q5SSN7 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Sft2d1Q5SSN7 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Sft2d1Q5SSN7 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Sft2d1Q5SSN7 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Sft2d1Q5SSN7 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Sft2d1Q5SSN7 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Sft2d1Q5SSN7 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Sft2d1Q5SSN7 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Sft2d1Q5SSN7 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Sft2d1Q5SSN7 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Sft2d1Q5SSN7 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Sft2d1Q5SSN7 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Sft2d1Q5SSN7 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Sft2d1Q5SSN7 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Sft2d1Q5SSN7 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Sft2d1Q5SSN7 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Sft2d1Q5SSN7 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Sft2d1Q5SSN7 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Sft2d1Q5SSN7 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Sft2d1Q5SSN7 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Sft2d1Q5SSN7 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Sft2d1Q5SSN7 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Sft2d1Q5SSN7 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Sft2d1Q5SSN7 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Sft2d1Q5SSN7 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Sft2d1Q5SSN7 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Sft2d1Q5SSN7 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Sft2d1Q5SSN7 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Sft2d1Q5SSN7 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Sft2d1Q5SSN7 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Sft2d1Q5SSN7 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Sft2d1Q5SSN7 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Sft2d1Q5SSN7 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Sft2d1Q5SSN7 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Sft2d1Q5SSN7 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Sft2d1Q5SSN7 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Sft2d1Q5SSN7 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Sft2d1Q5SSN7 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Sft2d1Q5SSN7 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Sft2d1Q5SSN7 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Sft2d1Q5SSN7 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Sft2d1Q5SSN7 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Sft2d1Q5SSN7 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Sft2d1Q5SSN7 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Sft2d1Q5SSN7 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Sft2d1Q5SSN7 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Sft2d1Q5SSN7 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Sft2d1Q5SSN7 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Sft2d1Q5SSN7 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Sft2d1Q5SSN7 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Sft2d1Q5SSN7 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Sft2d1Q5SSN7 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Sft2d1Q5SSN7 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Sft2d1Q5SSN7 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Sft2d1Q5SSN7 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sft2d1Q5SSN7 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sft2d1Q5SSN7 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Sft2d1Q5SSN7 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sft2d1Q5SSN7 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sft2d1Q5SSN7 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sft2d1Q5SSN7 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sft2d1Q5SSN7 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sft2d1Q5SSN7 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sft2d1Q5SSN7 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sft2d1Q5SSN7 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sft2d1Q5SSN7 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sft2d1Q5SSN7 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sft2d1Q5SSN7 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sft2d1Q5SSN7 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sft2d1Q5SSN7 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Sft2d1Q5SSN7 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sft2d1Q5SSN7 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sft2d1Q5SSN7 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sft2d1Q5SSN7 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sft2d1Q5SSN7 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sft2d1Q5SSN7 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sft2d1Q5SSN7 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sft2d1Q5SSN7 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sft2d1Q5SSN7 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sft2d1Q5SSN7 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sft2d1Q5SSN7 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sft2d1Q5SSN7 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sft2d1Q5SSN7 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sft2d1Q5SSN7 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sft2d1Q5SSN7 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sft2d1Q5SSN7 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Sft2d1Q5SSN7 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Sft2d1Q5SSN7 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Sft2d1Q5SSN7 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Sft2d1Q5SSN7 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Sft2d1Q5SSN7 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Sft2d1Q5SSN7 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Sft2d1Q5SSN7 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Sft2d1Q5SSN7 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sft2d1Q5SSN7 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sft2d1Q5SSN7 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sft2d1Q5SSN7 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sft2d1Q5SSN7 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sft2d1Q5SSN7 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.3 ms