Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSH7

Zzef1, Zinc finger ZZ-type and EF-hand domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 2,924 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zzef1Q5SSH7 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Zzef1Q5SSH7 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Zzef1Q5SSH7 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Zzef1Q5SSH7 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Zzef1Q5SSH7 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Zzef1Q5SSH7 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Zzef1Q5SSH7 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Zzef1Q5SSH7 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Zzef1Q5SSH7 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Zzef1Q5SSH7 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Zzef1Q5SSH7 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Zzef1Q5SSH7 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Zzef1Q5SSH7 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Zzef1Q5SSH7 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Zzef1Q5SSH7 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Zzef1Q5SSH7 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Zzef1Q5SSH7 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Zzef1Q5SSH7 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Zzef1Q5SSH7 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Zzef1Q5SSH7 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Zzef1Q5SSH7 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Zzef1Q5SSH7 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Zzef1Q5SSH7 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Zzef1Q5SSH7 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Zzef1Q5SSH7 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Zzef1Q5SSH7 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Zzef1Q5SSH7 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
Zzef1Q5SSH7 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Zzef1Q5SSH7 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Zzef1Q5SSH7 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Zzef1Q5SSH7 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Zzef1Q5SSH7 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Zzef1Q5SSH7 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
Zzef1Q5SSH7 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.7
Zzef1Q5SSH7 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
Zzef1Q5SSH7 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Zzef1Q5SSH7 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Zzef1Q5SSH7 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Zzef1Q5SSH7 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Zzef1Q5SSH7 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Zzef1Q5SSH7 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Zzef1Q5SSH7 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Zzef1Q5SSH7 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Zzef1Q5SSH7 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Zzef1Q5SSH7 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Zzef1Q5SSH7 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Zzef1Q5SSH7 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
Zzef1Q5SSH7 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
Zzef1Q5SSH7 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Zzef1Q5SSH7 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Zzef1Q5SSH7 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Zzef1Q5SSH7 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Zzef1Q5SSH7 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Zzef1Q5SSH7 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Zzef1Q5SSH7 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Zzef1Q5SSH7 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Zzef1Q5SSH7 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Zzef1Q5SSH7 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Zzef1Q5SSH7 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Zzef1Q5SSH7 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Zzef1Q5SSH7 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Zzef1Q5SSH7 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Zzef1Q5SSH7 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Zzef1Q5SSH7 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Zzef1Q5SSH7 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Zzef1Q5SSH7 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Zzef1Q5SSH7 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Zzef1Q5SSH7 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Zzef1Q5SSH7 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Zzef1Q5SSH7 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Zzef1Q5SSH7 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC19.33■□□□□ 0.69
Zzef1Q5SSH7 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Zzef1Q5SSH7 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Zzef1Q5SSH7 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Zzef1Q5SSH7 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Zzef1Q5SSH7 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Zzef1Q5SSH7 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Zzef1Q5SSH7 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Zzef1Q5SSH7 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Zzef1Q5SSH7 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Zzef1Q5SSH7 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Zzef1Q5SSH7 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Zzef1Q5SSH7 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Zzef1Q5SSH7 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Zzef1Q5SSH7 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Zzef1Q5SSH7 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Zzef1Q5SSH7 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Zzef1Q5SSH7 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Zzef1Q5SSH7 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Zzef1Q5SSH7 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Zzef1Q5SSH7 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Zzef1Q5SSH7 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Zzef1Q5SSH7 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Zzef1Q5SSH7 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Zzef1Q5SSH7 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Zzef1Q5SSH7 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Zzef1Q5SSH7 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Zzef1Q5SSH7 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Zzef1Q5SSH7 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Zzef1Q5SSH7 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.3 ms