Protein–RNA interactions for Protein: Q5ND29

Rilp, Rab-interacting lysosomal protein, mousemouse

Predictions only

Length 369 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RilpQ5ND29 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RilpQ5ND29 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RilpQ5ND29 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RilpQ5ND29 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RilpQ5ND29 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RilpQ5ND29 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RilpQ5ND29 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RilpQ5ND29 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RilpQ5ND29 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RilpQ5ND29 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RilpQ5ND29 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RilpQ5ND29 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RilpQ5ND29 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RilpQ5ND29 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RilpQ5ND29 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RilpQ5ND29 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RilpQ5ND29 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
RilpQ5ND29 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RilpQ5ND29 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RilpQ5ND29 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RilpQ5ND29 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RilpQ5ND29 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RilpQ5ND29 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RilpQ5ND29 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RilpQ5ND29 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RilpQ5ND29 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RilpQ5ND29 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RilpQ5ND29 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
RilpQ5ND29 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RilpQ5ND29 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RilpQ5ND29 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RilpQ5ND29 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RilpQ5ND29 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RilpQ5ND29 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RilpQ5ND29 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RilpQ5ND29 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RilpQ5ND29 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RilpQ5ND29 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RilpQ5ND29 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RilpQ5ND29 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RilpQ5ND29 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
RilpQ5ND29 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RilpQ5ND29 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RilpQ5ND29 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RilpQ5ND29 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RilpQ5ND29 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RilpQ5ND29 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RilpQ5ND29 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RilpQ5ND29 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RilpQ5ND29 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RilpQ5ND29 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RilpQ5ND29 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RilpQ5ND29 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RilpQ5ND29 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RilpQ5ND29 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RilpQ5ND29 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RilpQ5ND29 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RilpQ5ND29 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RilpQ5ND29 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RilpQ5ND29 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RilpQ5ND29 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RilpQ5ND29 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RilpQ5ND29 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RilpQ5ND29 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
RilpQ5ND29 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RilpQ5ND29 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RilpQ5ND29 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RilpQ5ND29 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RilpQ5ND29 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RilpQ5ND29 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RilpQ5ND29 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RilpQ5ND29 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RilpQ5ND29 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RilpQ5ND29 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RilpQ5ND29 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
RilpQ5ND29 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RilpQ5ND29 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RilpQ5ND29 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RilpQ5ND29 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RilpQ5ND29 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RilpQ5ND29 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RilpQ5ND29 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RilpQ5ND29 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
RilpQ5ND29 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RilpQ5ND29 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
RilpQ5ND29 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RilpQ5ND29 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RilpQ5ND29 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RilpQ5ND29 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RilpQ5ND29 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RilpQ5ND29 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RilpQ5ND29 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RilpQ5ND29 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RilpQ5ND29 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
RilpQ5ND29 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RilpQ5ND29 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RilpQ5ND29 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RilpQ5ND29 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RilpQ5ND29 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RilpQ5ND29 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.5 ms