Protein–RNA interactions for Protein: Q5G5D5

Syna, Syncytin-A, mousemouse

Predictions only

Length 617 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SynaQ5G5D5 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SynaQ5G5D5 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SynaQ5G5D5 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
SynaQ5G5D5 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SynaQ5G5D5 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SynaQ5G5D5 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SynaQ5G5D5 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SynaQ5G5D5 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SynaQ5G5D5 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SynaQ5G5D5 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SynaQ5G5D5 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SynaQ5G5D5 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
SynaQ5G5D5 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SynaQ5G5D5 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SynaQ5G5D5 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SynaQ5G5D5 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SynaQ5G5D5 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SynaQ5G5D5 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SynaQ5G5D5 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SynaQ5G5D5 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SynaQ5G5D5 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
SynaQ5G5D5 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SynaQ5G5D5 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SynaQ5G5D5 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SynaQ5G5D5 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SynaQ5G5D5 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SynaQ5G5D5 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SynaQ5G5D5 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SynaQ5G5D5 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SynaQ5G5D5 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SynaQ5G5D5 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SynaQ5G5D5 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SynaQ5G5D5 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SynaQ5G5D5 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SynaQ5G5D5 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
SynaQ5G5D5 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SynaQ5G5D5 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SynaQ5G5D5 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SynaQ5G5D5 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SynaQ5G5D5 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SynaQ5G5D5 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SynaQ5G5D5 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SynaQ5G5D5 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SynaQ5G5D5 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SynaQ5G5D5 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SynaQ5G5D5 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SynaQ5G5D5 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SynaQ5G5D5 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SynaQ5G5D5 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SynaQ5G5D5 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SynaQ5G5D5 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SynaQ5G5D5 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SynaQ5G5D5 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SynaQ5G5D5 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SynaQ5G5D5 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SynaQ5G5D5 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SynaQ5G5D5 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SynaQ5G5D5 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SynaQ5G5D5 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SynaQ5G5D5 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SynaQ5G5D5 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
SynaQ5G5D5 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SynaQ5G5D5 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SynaQ5G5D5 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SynaQ5G5D5 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SynaQ5G5D5 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SynaQ5G5D5 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SynaQ5G5D5 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SynaQ5G5D5 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SynaQ5G5D5 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
SynaQ5G5D5 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SynaQ5G5D5 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SynaQ5G5D5 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SynaQ5G5D5 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SynaQ5G5D5 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SynaQ5G5D5 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SynaQ5G5D5 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
SynaQ5G5D5 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
SynaQ5G5D5 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SynaQ5G5D5 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SynaQ5G5D5 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SynaQ5G5D5 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SynaQ5G5D5 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SynaQ5G5D5 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SynaQ5G5D5 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SynaQ5G5D5 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SynaQ5G5D5 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SynaQ5G5D5 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SynaQ5G5D5 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SynaQ5G5D5 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
SynaQ5G5D5 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SynaQ5G5D5 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SynaQ5G5D5 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SynaQ5G5D5 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SynaQ5G5D5 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SynaQ5G5D5 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
SynaQ5G5D5 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SynaQ5G5D5 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SynaQ5G5D5 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SynaQ5G5D5 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 294.9 ms