Protein–RNA interactions for Protein: Q5DU56

Nlrc3, Protein NLRC3, mousemouse

Predictions only

Length 1,064 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlrc3Q5DU56 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Nlrc3Q5DU56 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Nlrc3Q5DU56 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Nlrc3Q5DU56 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Nlrc3Q5DU56 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Nlrc3Q5DU56 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Nlrc3Q5DU56 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Nlrc3Q5DU56 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
Nlrc3Q5DU56 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Nlrc3Q5DU56 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
Nlrc3Q5DU56 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
Nlrc3Q5DU56 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Nlrc3Q5DU56 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
Nlrc3Q5DU56 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Nlrc3Q5DU56 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Nlrc3Q5DU56 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC19.84■□□□□ 0.77
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Nlrc3Q5DU56 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Nlrc3Q5DU56 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Nlrc3Q5DU56 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Nlrc3Q5DU56 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Nlrc3Q5DU56 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Nlrc3Q5DU56 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Nlrc3Q5DU56 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Nlrc3Q5DU56 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Nlrc3Q5DU56 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Nlrc3Q5DU56 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Nlrc3Q5DU56 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Nlrc3Q5DU56 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Nlrc3Q5DU56 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Nlrc3Q5DU56 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Nlrc3Q5DU56 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Nlrc3Q5DU56 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Nlrc3Q5DU56 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Nlrc3Q5DU56 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Nlrc3Q5DU56 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Nlrc3Q5DU56 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Nlrc3Q5DU56 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
Nlrc3Q5DU56 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Nlrc3Q5DU56 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Nlrc3Q5DU56 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Nlrc3Q5DU56 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Nlrc3Q5DU56 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Nlrc3Q5DU56 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Nlrc3Q5DU56 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Nlrc3Q5DU56 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Nlrc3Q5DU56 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Nlrc3Q5DU56 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Nlrc3Q5DU56 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Nlrc3Q5DU56 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Nlrc3Q5DU56 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Nlrc3Q5DU56 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Nlrc3Q5DU56 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Nlrc3Q5DU56 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Nlrc3Q5DU56 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Nlrc3Q5DU56 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Nlrc3Q5DU56 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Nlrc3Q5DU56 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Nlrc3Q5DU56 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Nlrc3Q5DU56 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Nlrc3Q5DU56 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Nlrc3Q5DU56 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Nlrc3Q5DU56 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Nlrc3Q5DU56 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
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Nlrc3Q5DU56 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Nlrc3Q5DU56 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Nlrc3Q5DU56 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Nlrc3Q5DU56 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Nlrc3Q5DU56 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Nlrc3Q5DU56 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Nlrc3Q5DU56 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Nlrc3Q5DU56 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Nlrc3Q5DU56 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Nlrc3Q5DU56 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Nlrc3Q5DU56 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Nlrc3Q5DU56 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Nlrc3Q5DU56 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Nlrc3Q5DU56 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Nlrc3Q5DU56 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Nlrc3Q5DU56 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Nlrc3Q5DU56 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Nlrc3Q5DU56 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Nlrc3Q5DU56 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Nlrc3Q5DU56 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Nlrc3Q5DU56 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Nlrc3Q5DU56 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Nlrc3Q5DU56 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Nlrc3Q5DU56 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Nlrc3Q5DU56 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Nlrc3Q5DU56 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Nlrc3Q5DU56 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
Nlrc3Q5DU56 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Nlrc3Q5DU56 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
Nlrc3Q5DU56 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms