Protein–RNA interactions for Protein: Q5DTK1

Chsy3, Chondroitin sulfate synthase 3, mousemouse

Predictions only

Length 884 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chsy3Q5DTK1 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Chsy3Q5DTK1 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Chsy3Q5DTK1 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Chsy3Q5DTK1 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Chsy3Q5DTK1 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Chsy3Q5DTK1 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Chsy3Q5DTK1 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Chsy3Q5DTK1 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Chsy3Q5DTK1 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Chsy3Q5DTK1 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Chsy3Q5DTK1 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Chsy3Q5DTK1 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Chsy3Q5DTK1 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Chsy3Q5DTK1 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Chsy3Q5DTK1 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Chsy3Q5DTK1 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Chsy3Q5DTK1 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Chsy3Q5DTK1 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Chsy3Q5DTK1 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Chsy3Q5DTK1 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Chsy3Q5DTK1 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Chsy3Q5DTK1 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Chsy3Q5DTK1 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Chsy3Q5DTK1 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Chsy3Q5DTK1 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Chsy3Q5DTK1 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Chsy3Q5DTK1 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Chsy3Q5DTK1 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Chsy3Q5DTK1 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Chsy3Q5DTK1 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Chsy3Q5DTK1 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Chsy3Q5DTK1 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Chsy3Q5DTK1 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Chsy3Q5DTK1 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Chsy3Q5DTK1 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Chsy3Q5DTK1 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Chsy3Q5DTK1 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Chsy3Q5DTK1 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Chsy3Q5DTK1 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Chsy3Q5DTK1 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Chsy3Q5DTK1 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Chsy3Q5DTK1 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Chsy3Q5DTK1 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Chsy3Q5DTK1 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Chsy3Q5DTK1 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Chsy3Q5DTK1 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Chsy3Q5DTK1 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Chsy3Q5DTK1 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Chsy3Q5DTK1 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Chsy3Q5DTK1 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Chsy3Q5DTK1 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Chsy3Q5DTK1 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC20.45■□□□□ 0.87
Chsy3Q5DTK1 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
Chsy3Q5DTK1 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Chsy3Q5DTK1 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Chsy3Q5DTK1 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Chsy3Q5DTK1 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Chsy3Q5DTK1 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Chsy3Q5DTK1 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Chsy3Q5DTK1 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Chsy3Q5DTK1 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Chsy3Q5DTK1 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Chsy3Q5DTK1 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Chsy3Q5DTK1 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Chsy3Q5DTK1 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Chsy3Q5DTK1 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Chsy3Q5DTK1 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Chsy3Q5DTK1 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Chsy3Q5DTK1 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Chsy3Q5DTK1 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Chsy3Q5DTK1 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Chsy3Q5DTK1 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Chsy3Q5DTK1 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Chsy3Q5DTK1 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Chsy3Q5DTK1 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Chsy3Q5DTK1 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Chsy3Q5DTK1 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Chsy3Q5DTK1 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Chsy3Q5DTK1 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Chsy3Q5DTK1 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Chsy3Q5DTK1 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Chsy3Q5DTK1 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Chsy3Q5DTK1 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Chsy3Q5DTK1 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Chsy3Q5DTK1 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Chsy3Q5DTK1 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Chsy3Q5DTK1 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Chsy3Q5DTK1 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Chsy3Q5DTK1 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Chsy3Q5DTK1 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Chsy3Q5DTK1 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Chsy3Q5DTK1 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Chsy3Q5DTK1 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Chsy3Q5DTK1 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Chsy3Q5DTK1 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Chsy3Q5DTK1 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Chsy3Q5DTK1 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Chsy3Q5DTK1 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Chsy3Q5DTK1 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Chsy3Q5DTK1 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.9 ms