Protein–RNA interactions for Protein: Q52KH6

Gm14685, DNA segment, Chr X, Baylor 18, mousemouse

Predictions only

Length 695 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm14685Q52KH6 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gm14685Q52KH6 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gm14685Q52KH6 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gm14685Q52KH6 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gm14685Q52KH6 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gm14685Q52KH6 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gm14685Q52KH6 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gm14685Q52KH6 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Gm14685Q52KH6 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gm14685Q52KH6 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Gm14685Q52KH6 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gm14685Q52KH6 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gm14685Q52KH6 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gm14685Q52KH6 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gm14685Q52KH6 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gm14685Q52KH6 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Gm14685Q52KH6 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gm14685Q52KH6 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gm14685Q52KH6 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gm14685Q52KH6 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Gm14685Q52KH6 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Gm14685Q52KH6 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Gm14685Q52KH6 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Gm14685Q52KH6 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Gm14685Q52KH6 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Gm14685Q52KH6 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gm14685Q52KH6 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gm14685Q52KH6 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gm14685Q52KH6 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gm14685Q52KH6 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gm14685Q52KH6 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gm14685Q52KH6 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gm14685Q52KH6 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gm14685Q52KH6 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gm14685Q52KH6 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gm14685Q52KH6 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gm14685Q52KH6 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gm14685Q52KH6 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Gm14685Q52KH6 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gm14685Q52KH6 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gm14685Q52KH6 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gm14685Q52KH6 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gm14685Q52KH6 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gm14685Q52KH6 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gm14685Q52KH6 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gm14685Q52KH6 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gm14685Q52KH6 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gm14685Q52KH6 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gm14685Q52KH6 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gm14685Q52KH6 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gm14685Q52KH6 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gm14685Q52KH6 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gm14685Q52KH6 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gm14685Q52KH6 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gm14685Q52KH6 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gm14685Q52KH6 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gm14685Q52KH6 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gm14685Q52KH6 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gm14685Q52KH6 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gm14685Q52KH6 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gm14685Q52KH6 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Gm14685Q52KH6 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gm14685Q52KH6 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gm14685Q52KH6 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Gm14685Q52KH6 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gm14685Q52KH6 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Gm14685Q52KH6 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gm14685Q52KH6 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gm14685Q52KH6 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gm14685Q52KH6 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gm14685Q52KH6 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gm14685Q52KH6 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gm14685Q52KH6 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gm14685Q52KH6 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gm14685Q52KH6 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gm14685Q52KH6 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gm14685Q52KH6 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gm14685Q52KH6 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gm14685Q52KH6 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gm14685Q52KH6 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gm14685Q52KH6 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gm14685Q52KH6 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gm14685Q52KH6 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gm14685Q52KH6 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gm14685Q52KH6 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gm14685Q52KH6 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gm14685Q52KH6 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gm14685Q52KH6 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gm14685Q52KH6 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gm14685Q52KH6 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gm14685Q52KH6 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gm14685Q52KH6 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gm14685Q52KH6 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gm14685Q52KH6 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gm14685Q52KH6 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gm14685Q52KH6 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gm14685Q52KH6 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Gm14685Q52KH6 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gm14685Q52KH6 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gm14685Q52KH6 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.4 ms