Protein–RNA interactions for Protein: Q501J7

Phactr4, Phosphatase and actin regulator 4, mousemouse

Predictions only

Length 694 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phactr4Q501J7 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Phactr4Q501J7 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Phactr4Q501J7 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Phactr4Q501J7 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Phactr4Q501J7 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Phactr4Q501J7 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Phactr4Q501J7 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Phactr4Q501J7 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Phactr4Q501J7 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Phactr4Q501J7 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Phactr4Q501J7 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Phactr4Q501J7 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Phactr4Q501J7 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Phactr4Q501J7 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Phactr4Q501J7 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Phactr4Q501J7 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Phactr4Q501J7 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Phactr4Q501J7 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Phactr4Q501J7 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Phactr4Q501J7 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Phactr4Q501J7 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Phactr4Q501J7 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Phactr4Q501J7 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Phactr4Q501J7 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Phactr4Q501J7 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Phactr4Q501J7 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Phactr4Q501J7 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Phactr4Q501J7 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Phactr4Q501J7 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Phactr4Q501J7 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Phactr4Q501J7 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Phactr4Q501J7 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Phactr4Q501J7 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Phactr4Q501J7 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Phactr4Q501J7 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Phactr4Q501J7 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Phactr4Q501J7 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Phactr4Q501J7 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Phactr4Q501J7 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Phactr4Q501J7 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Phactr4Q501J7 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Phactr4Q501J7 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Phactr4Q501J7 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Phactr4Q501J7 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Phactr4Q501J7 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Phactr4Q501J7 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Phactr4Q501J7 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Phactr4Q501J7 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Phactr4Q501J7 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Phactr4Q501J7 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Phactr4Q501J7 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Phactr4Q501J7 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Phactr4Q501J7 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Phactr4Q501J7 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Phactr4Q501J7 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Phactr4Q501J7 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Phactr4Q501J7 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Phactr4Q501J7 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Phactr4Q501J7 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Phactr4Q501J7 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Phactr4Q501J7 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Phactr4Q501J7 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Phactr4Q501J7 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Phactr4Q501J7 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Phactr4Q501J7 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Phactr4Q501J7 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Phactr4Q501J7 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Phactr4Q501J7 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Phactr4Q501J7 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Phactr4Q501J7 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Phactr4Q501J7 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Phactr4Q501J7 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Phactr4Q501J7 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Phactr4Q501J7 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Phactr4Q501J7 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Phactr4Q501J7 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Phactr4Q501J7 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Phactr4Q501J7 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Phactr4Q501J7 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Phactr4Q501J7 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Phactr4Q501J7 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Phactr4Q501J7 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Phactr4Q501J7 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Phactr4Q501J7 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Phactr4Q501J7 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Phactr4Q501J7 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Phactr4Q501J7 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Phactr4Q501J7 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Phactr4Q501J7 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Phactr4Q501J7 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Phactr4Q501J7 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Phactr4Q501J7 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Phactr4Q501J7 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Phactr4Q501J7 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Phactr4Q501J7 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Phactr4Q501J7 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Phactr4Q501J7 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Phactr4Q501J7 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Phactr4Q501J7 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Phactr4Q501J7 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.2 ms