Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0C5

Usp48, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 48, mousemouse

Predictions only

Length 1,052 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp48Q3V0C5 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Usp48Q3V0C5 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Usp48Q3V0C5 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Usp48Q3V0C5 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Usp48Q3V0C5 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Usp48Q3V0C5 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Usp48Q3V0C5 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Usp48Q3V0C5 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Usp48Q3V0C5 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Usp48Q3V0C5 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Usp48Q3V0C5 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Usp48Q3V0C5 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Usp48Q3V0C5 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
Usp48Q3V0C5 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Usp48Q3V0C5 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Usp48Q3V0C5 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
Usp48Q3V0C5 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
Usp48Q3V0C5 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Usp48Q3V0C5 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Usp48Q3V0C5 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Usp48Q3V0C5 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Usp48Q3V0C5 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Usp48Q3V0C5 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
Usp48Q3V0C5 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Usp48Q3V0C5 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Usp48Q3V0C5 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Usp48Q3V0C5 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Usp48Q3V0C5 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Usp48Q3V0C5 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
Usp48Q3V0C5 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Usp48Q3V0C5 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Usp48Q3V0C5 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Usp48Q3V0C5 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Usp48Q3V0C5 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Usp48Q3V0C5 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Usp48Q3V0C5 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Usp48Q3V0C5 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Usp48Q3V0C5 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Usp48Q3V0C5 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Usp48Q3V0C5 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Usp48Q3V0C5 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Usp48Q3V0C5 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Usp48Q3V0C5 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
Usp48Q3V0C5 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Usp48Q3V0C5 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
Usp48Q3V0C5 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Usp48Q3V0C5 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Usp48Q3V0C5 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Usp48Q3V0C5 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
Usp48Q3V0C5 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Usp48Q3V0C5 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Usp48Q3V0C5 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Usp48Q3V0C5 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Usp48Q3V0C5 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Usp48Q3V0C5 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Usp48Q3V0C5 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Usp48Q3V0C5 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Usp48Q3V0C5 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Usp48Q3V0C5 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
Usp48Q3V0C5 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Usp48Q3V0C5 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Usp48Q3V0C5 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Usp48Q3V0C5 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Usp48Q3V0C5 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Usp48Q3V0C5 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Usp48Q3V0C5 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Usp48Q3V0C5 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Usp48Q3V0C5 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Usp48Q3V0C5 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Usp48Q3V0C5 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Usp48Q3V0C5 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
Usp48Q3V0C5 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Usp48Q3V0C5 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Usp48Q3V0C5 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Usp48Q3V0C5 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Usp48Q3V0C5 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Usp48Q3V0C5 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Usp48Q3V0C5 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Usp48Q3V0C5 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Usp48Q3V0C5 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
Usp48Q3V0C5 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Usp48Q3V0C5 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Usp48Q3V0C5 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Usp48Q3V0C5 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Usp48Q3V0C5 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Usp48Q3V0C5 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Usp48Q3V0C5 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Usp48Q3V0C5 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Usp48Q3V0C5 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Usp48Q3V0C5 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
Usp48Q3V0C5 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Usp48Q3V0C5 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Usp48Q3V0C5 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
Usp48Q3V0C5 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Usp48Q3V0C5 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Usp48Q3V0C5 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Usp48Q3V0C5 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Usp48Q3V0C5 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Usp48Q3V0C5 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Usp48Q3V0C5 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.4 ms