Protein–RNA interactions for Protein: Q3UUV5

Skap1, Src kinase-associated phosphoprotein 1, mousemouse

Predictions only

Length 355 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Skap1Q3UUV5 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Skap1Q3UUV5 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Skap1Q3UUV5 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Skap1Q3UUV5 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Skap1Q3UUV5 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Skap1Q3UUV5 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Skap1Q3UUV5 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Skap1Q3UUV5 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Skap1Q3UUV5 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Skap1Q3UUV5 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Skap1Q3UUV5 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Skap1Q3UUV5 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Skap1Q3UUV5 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Skap1Q3UUV5 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Skap1Q3UUV5 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Skap1Q3UUV5 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Skap1Q3UUV5 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Skap1Q3UUV5 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Skap1Q3UUV5 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Skap1Q3UUV5 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Skap1Q3UUV5 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Skap1Q3UUV5 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Skap1Q3UUV5 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Skap1Q3UUV5 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Skap1Q3UUV5 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Skap1Q3UUV5 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Skap1Q3UUV5 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Skap1Q3UUV5 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Skap1Q3UUV5 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Skap1Q3UUV5 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Skap1Q3UUV5 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Skap1Q3UUV5 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Skap1Q3UUV5 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Skap1Q3UUV5 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Skap1Q3UUV5 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Skap1Q3UUV5 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Skap1Q3UUV5 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Skap1Q3UUV5 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Skap1Q3UUV5 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Skap1Q3UUV5 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Skap1Q3UUV5 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Skap1Q3UUV5 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Skap1Q3UUV5 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Skap1Q3UUV5 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Skap1Q3UUV5 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Skap1Q3UUV5 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Skap1Q3UUV5 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Skap1Q3UUV5 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Skap1Q3UUV5 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Skap1Q3UUV5 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Skap1Q3UUV5 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Skap1Q3UUV5 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Skap1Q3UUV5 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Skap1Q3UUV5 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Skap1Q3UUV5 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Skap1Q3UUV5 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Skap1Q3UUV5 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Skap1Q3UUV5 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Skap1Q3UUV5 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Skap1Q3UUV5 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Skap1Q3UUV5 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Skap1Q3UUV5 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Skap1Q3UUV5 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Skap1Q3UUV5 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Skap1Q3UUV5 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Skap1Q3UUV5 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Skap1Q3UUV5 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Skap1Q3UUV5 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Skap1Q3UUV5 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Skap1Q3UUV5 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Skap1Q3UUV5 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Skap1Q3UUV5 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Skap1Q3UUV5 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Skap1Q3UUV5 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Skap1Q3UUV5 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Skap1Q3UUV5 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Skap1Q3UUV5 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Skap1Q3UUV5 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Skap1Q3UUV5 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Skap1Q3UUV5 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Skap1Q3UUV5 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Skap1Q3UUV5 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Skap1Q3UUV5 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Skap1Q3UUV5 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Skap1Q3UUV5 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Skap1Q3UUV5 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Skap1Q3UUV5 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Skap1Q3UUV5 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Skap1Q3UUV5 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Skap1Q3UUV5 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Skap1Q3UUV5 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Skap1Q3UUV5 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Skap1Q3UUV5 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Skap1Q3UUV5 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Skap1Q3UUV5 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Skap1Q3UUV5 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Skap1Q3UUV5 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Skap1Q3UUV5 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Skap1Q3UUV5 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Skap1Q3UUV5 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.3 ms