Protein–RNA interactions for Protein: Q3UU43

Chpf2, Hexosyltransferase, mousemouse

Predictions only

Length 768 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chpf2Q3UU43 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Chpf2Q3UU43 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Chpf2Q3UU43 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Chpf2Q3UU43 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Chpf2Q3UU43 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Chpf2Q3UU43 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Chpf2Q3UU43 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Chpf2Q3UU43 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
Chpf2Q3UU43 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Chpf2Q3UU43 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Chpf2Q3UU43 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Chpf2Q3UU43 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Chpf2Q3UU43 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Chpf2Q3UU43 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Chpf2Q3UU43 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Chpf2Q3UU43 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Chpf2Q3UU43 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Chpf2Q3UU43 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Chpf2Q3UU43 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Chpf2Q3UU43 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
Chpf2Q3UU43 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
Chpf2Q3UU43 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Chpf2Q3UU43 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Chpf2Q3UU43 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Chpf2Q3UU43 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Chpf2Q3UU43 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Chpf2Q3UU43 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Chpf2Q3UU43 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Chpf2Q3UU43 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Chpf2Q3UU43 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Chpf2Q3UU43 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Chpf2Q3UU43 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Chpf2Q3UU43 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Chpf2Q3UU43 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Chpf2Q3UU43 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Chpf2Q3UU43 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Chpf2Q3UU43 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Chpf2Q3UU43 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Chpf2Q3UU43 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Chpf2Q3UU43 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Chpf2Q3UU43 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Chpf2Q3UU43 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Chpf2Q3UU43 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Chpf2Q3UU43 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Chpf2Q3UU43 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Chpf2Q3UU43 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Chpf2Q3UU43 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Chpf2Q3UU43 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Chpf2Q3UU43 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Chpf2Q3UU43 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Chpf2Q3UU43 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Chpf2Q3UU43 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Chpf2Q3UU43 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Chpf2Q3UU43 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Chpf2Q3UU43 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Chpf2Q3UU43 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
Chpf2Q3UU43 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Chpf2Q3UU43 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Chpf2Q3UU43 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Chpf2Q3UU43 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Chpf2Q3UU43 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Chpf2Q3UU43 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Chpf2Q3UU43 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
Chpf2Q3UU43 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Chpf2Q3UU43 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Chpf2Q3UU43 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Chpf2Q3UU43 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Chpf2Q3UU43 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Chpf2Q3UU43 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Chpf2Q3UU43 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Chpf2Q3UU43 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Chpf2Q3UU43 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Chpf2Q3UU43 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Chpf2Q3UU43 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Chpf2Q3UU43 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Chpf2Q3UU43 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Chpf2Q3UU43 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Chpf2Q3UU43 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Chpf2Q3UU43 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Chpf2Q3UU43 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Chpf2Q3UU43 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Chpf2Q3UU43 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Chpf2Q3UU43 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Chpf2Q3UU43 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Chpf2Q3UU43 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Chpf2Q3UU43 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Chpf2Q3UU43 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Chpf2Q3UU43 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Chpf2Q3UU43 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Chpf2Q3UU43 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Chpf2Q3UU43 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Chpf2Q3UU43 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
Chpf2Q3UU43 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
Chpf2Q3UU43 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
Chpf2Q3UU43 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
Chpf2Q3UU43 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
Chpf2Q3UU43 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
Chpf2Q3UU43 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Chpf2Q3UU43 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Chpf2Q3UU43 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.1 ms