Protein–RNA interactions for Protein: Q3US17

Znf48, Zinc finger protein 48, mousemouse

Predictions only

Length 591 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf48Q3US17 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Znf48Q3US17 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Znf48Q3US17 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Znf48Q3US17 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Znf48Q3US17 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Znf48Q3US17 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Znf48Q3US17 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Znf48Q3US17 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Znf48Q3US17 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Znf48Q3US17 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Znf48Q3US17 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Znf48Q3US17 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Znf48Q3US17 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Znf48Q3US17 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Znf48Q3US17 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Znf48Q3US17 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Znf48Q3US17 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Znf48Q3US17 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Znf48Q3US17 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Znf48Q3US17 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Znf48Q3US17 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Znf48Q3US17 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Znf48Q3US17 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Znf48Q3US17 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Znf48Q3US17 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Znf48Q3US17 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Znf48Q3US17 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Znf48Q3US17 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Znf48Q3US17 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Znf48Q3US17 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Znf48Q3US17 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Znf48Q3US17 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Znf48Q3US17 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Znf48Q3US17 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Znf48Q3US17 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Znf48Q3US17 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Znf48Q3US17 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Znf48Q3US17 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Znf48Q3US17 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Znf48Q3US17 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Znf48Q3US17 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Znf48Q3US17 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Znf48Q3US17 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Znf48Q3US17 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Znf48Q3US17 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Znf48Q3US17 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Znf48Q3US17 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Znf48Q3US17 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Znf48Q3US17 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Znf48Q3US17 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Znf48Q3US17 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Znf48Q3US17 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Znf48Q3US17 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Znf48Q3US17 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Znf48Q3US17 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Znf48Q3US17 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Znf48Q3US17 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Znf48Q3US17 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Znf48Q3US17 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Znf48Q3US17 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Znf48Q3US17 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Znf48Q3US17 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Znf48Q3US17 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Znf48Q3US17 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Znf48Q3US17 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Znf48Q3US17 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Znf48Q3US17 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Znf48Q3US17 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Znf48Q3US17 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Znf48Q3US17 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Znf48Q3US17 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Znf48Q3US17 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Znf48Q3US17 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Znf48Q3US17 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Znf48Q3US17 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
Znf48Q3US17 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Znf48Q3US17 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Znf48Q3US17 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Znf48Q3US17 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Znf48Q3US17 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Znf48Q3US17 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Znf48Q3US17 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Znf48Q3US17 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Znf48Q3US17 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Znf48Q3US17 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Znf48Q3US17 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Znf48Q3US17 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Znf48Q3US17 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Znf48Q3US17 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Znf48Q3US17 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Znf48Q3US17 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Znf48Q3US17 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Znf48Q3US17 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Znf48Q3US17 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Znf48Q3US17 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Znf48Q3US17 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Znf48Q3US17 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Znf48Q3US17 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Znf48Q3US17 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Znf48Q3US17 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.4 ms