Protein–RNA interactions for Protein: Q3UQS8

Rbm20, RNA-binding protein 20, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,199 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbm20Q3UQS8 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Rbm20Q3UQS8 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Rbm20Q3UQS8 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Rbm20Q3UQS8 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Rbm20Q3UQS8 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Rbm20Q3UQS8 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Rbm20Q3UQS8 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Rbm20Q3UQS8 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Rbm20Q3UQS8 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Rbm20Q3UQS8 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Rbm20Q3UQS8 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Rbm20Q3UQS8 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Rbm20Q3UQS8 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Rbm20Q3UQS8 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Rbm20Q3UQS8 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Rbm20Q3UQS8 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Rbm20Q3UQS8 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Rbm20Q3UQS8 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rbm20Q3UQS8 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rbm20Q3UQS8 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rbm20Q3UQS8 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rbm20Q3UQS8 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Rbm20Q3UQS8 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Rbm20Q3UQS8 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Rbm20Q3UQS8 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Rbm20Q3UQS8 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Rbm20Q3UQS8 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Rbm20Q3UQS8 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Rbm20Q3UQS8 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Rbm20Q3UQS8 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Rbm20Q3UQS8 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Rbm20Q3UQS8 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Rbm20Q3UQS8 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Rbm20Q3UQS8 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Rbm20Q3UQS8 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Rbm20Q3UQS8 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Rbm20Q3UQS8 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Rbm20Q3UQS8 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Rbm20Q3UQS8 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Rbm20Q3UQS8 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Rbm20Q3UQS8 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Rbm20Q3UQS8 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rbm20Q3UQS8 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rbm20Q3UQS8 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rbm20Q3UQS8 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rbm20Q3UQS8 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rbm20Q3UQS8 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rbm20Q3UQS8 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rbm20Q3UQS8 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Rbm20Q3UQS8 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rbm20Q3UQS8 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rbm20Q3UQS8 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Rbm20Q3UQS8 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rbm20Q3UQS8 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rbm20Q3UQS8 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rbm20Q3UQS8 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rbm20Q3UQS8 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rbm20Q3UQS8 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rbm20Q3UQS8 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rbm20Q3UQS8 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Rbm20Q3UQS8 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rbm20Q3UQS8 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rbm20Q3UQS8 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rbm20Q3UQS8 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rbm20Q3UQS8 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Rbm20Q3UQS8 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rbm20Q3UQS8 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rbm20Q3UQS8 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rbm20Q3UQS8 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rbm20Q3UQS8 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rbm20Q3UQS8 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rbm20Q3UQS8 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rbm20Q3UQS8 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rbm20Q3UQS8 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rbm20Q3UQS8 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rbm20Q3UQS8 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rbm20Q3UQS8 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rbm20Q3UQS8 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rbm20Q3UQS8 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rbm20Q3UQS8 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rbm20Q3UQS8 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rbm20Q3UQS8 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rbm20Q3UQS8 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rbm20Q3UQS8 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rbm20Q3UQS8 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rbm20Q3UQS8 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rbm20Q3UQS8 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Rbm20Q3UQS8 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rbm20Q3UQS8 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rbm20Q3UQS8 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Rbm20Q3UQS8 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rbm20Q3UQS8 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Rbm20Q3UQS8 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Rbm20Q3UQS8 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rbm20Q3UQS8 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rbm20Q3UQS8 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rbm20Q3UQS8 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rbm20Q3UQS8 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rbm20Q3UQS8 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rbm20Q3UQS8 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
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