Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPV3

E130208F15Rik, RIKEN cDNA E130208F15 gene, mousemouse

Predictions only

Length 143 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E130208F15RikQ3UPV3 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
E130208F15RikQ3UPV3 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
E130208F15RikQ3UPV3 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
E130208F15RikQ3UPV3 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
E130208F15RikQ3UPV3 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
E130208F15RikQ3UPV3 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
E130208F15RikQ3UPV3 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
E130208F15RikQ3UPV3 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
E130208F15RikQ3UPV3 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
E130208F15RikQ3UPV3 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
E130208F15RikQ3UPV3 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
E130208F15RikQ3UPV3 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
E130208F15RikQ3UPV3 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
E130208F15RikQ3UPV3 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
E130208F15RikQ3UPV3 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
E130208F15RikQ3UPV3 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
E130208F15RikQ3UPV3 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
E130208F15RikQ3UPV3 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
E130208F15RikQ3UPV3 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
E130208F15RikQ3UPV3 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
E130208F15RikQ3UPV3 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
E130208F15RikQ3UPV3 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
E130208F15RikQ3UPV3 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
E130208F15RikQ3UPV3 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
E130208F15RikQ3UPV3 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
E130208F15RikQ3UPV3 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
E130208F15RikQ3UPV3 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
E130208F15RikQ3UPV3 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
E130208F15RikQ3UPV3 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
E130208F15RikQ3UPV3 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
E130208F15RikQ3UPV3 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
E130208F15RikQ3UPV3 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
E130208F15RikQ3UPV3 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
E130208F15RikQ3UPV3 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
E130208F15RikQ3UPV3 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
E130208F15RikQ3UPV3 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
E130208F15RikQ3UPV3 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
E130208F15RikQ3UPV3 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
E130208F15RikQ3UPV3 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
E130208F15RikQ3UPV3 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
E130208F15RikQ3UPV3 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
E130208F15RikQ3UPV3 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
E130208F15RikQ3UPV3 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
E130208F15RikQ3UPV3 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
E130208F15RikQ3UPV3 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
E130208F15RikQ3UPV3 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
E130208F15RikQ3UPV3 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
E130208F15RikQ3UPV3 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
E130208F15RikQ3UPV3 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
E130208F15RikQ3UPV3 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
E130208F15RikQ3UPV3 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
E130208F15RikQ3UPV3 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
E130208F15RikQ3UPV3 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
E130208F15RikQ3UPV3 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
E130208F15RikQ3UPV3 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
E130208F15RikQ3UPV3 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
E130208F15RikQ3UPV3 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
E130208F15RikQ3UPV3 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
E130208F15RikQ3UPV3 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
E130208F15RikQ3UPV3 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
E130208F15RikQ3UPV3 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
E130208F15RikQ3UPV3 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
E130208F15RikQ3UPV3 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
E130208F15RikQ3UPV3 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
E130208F15RikQ3UPV3 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
E130208F15RikQ3UPV3 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
E130208F15RikQ3UPV3 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
E130208F15RikQ3UPV3 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
E130208F15RikQ3UPV3 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
E130208F15RikQ3UPV3 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
E130208F15RikQ3UPV3 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
E130208F15RikQ3UPV3 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
E130208F15RikQ3UPV3 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
E130208F15RikQ3UPV3 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
E130208F15RikQ3UPV3 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
E130208F15RikQ3UPV3 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
E130208F15RikQ3UPV3 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
E130208F15RikQ3UPV3 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
E130208F15RikQ3UPV3 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
E130208F15RikQ3UPV3 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
E130208F15RikQ3UPV3 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
E130208F15RikQ3UPV3 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
E130208F15RikQ3UPV3 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
E130208F15RikQ3UPV3 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
E130208F15RikQ3UPV3 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
E130208F15RikQ3UPV3 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
E130208F15RikQ3UPV3 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
E130208F15RikQ3UPV3 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
E130208F15RikQ3UPV3 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
E130208F15RikQ3UPV3 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
E130208F15RikQ3UPV3 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
E130208F15RikQ3UPV3 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
E130208F15RikQ3UPV3 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
E130208F15RikQ3UPV3 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
E130208F15RikQ3UPV3 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
E130208F15RikQ3UPV3 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
E130208F15RikQ3UPV3 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
E130208F15RikQ3UPV3 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
E130208F15RikQ3UPV3 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
E130208F15RikQ3UPV3 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.4 ms