Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPR8

D13Ertd608e, D13Ertd608e protein, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
D13Ertd608eQ3UPR8 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
D13Ertd608eQ3UPR8 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
D13Ertd608eQ3UPR8 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
D13Ertd608eQ3UPR8 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
D13Ertd608eQ3UPR8 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
D13Ertd608eQ3UPR8 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
D13Ertd608eQ3UPR8 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
D13Ertd608eQ3UPR8 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC19.53■□□□□ 0.72
D13Ertd608eQ3UPR8 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
D13Ertd608eQ3UPR8 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
D13Ertd608eQ3UPR8 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
D13Ertd608eQ3UPR8 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
D13Ertd608eQ3UPR8 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
D13Ertd608eQ3UPR8 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
D13Ertd608eQ3UPR8 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
D13Ertd608eQ3UPR8 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
D13Ertd608eQ3UPR8 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
D13Ertd608eQ3UPR8 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
D13Ertd608eQ3UPR8 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
D13Ertd608eQ3UPR8 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
D13Ertd608eQ3UPR8 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC19.52■□□□□ 0.71
D13Ertd608eQ3UPR8 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
D13Ertd608eQ3UPR8 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
D13Ertd608eQ3UPR8 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
D13Ertd608eQ3UPR8 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
D13Ertd608eQ3UPR8 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
D13Ertd608eQ3UPR8 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
D13Ertd608eQ3UPR8 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
D13Ertd608eQ3UPR8 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
D13Ertd608eQ3UPR8 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
D13Ertd608eQ3UPR8 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
D13Ertd608eQ3UPR8 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
D13Ertd608eQ3UPR8 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
D13Ertd608eQ3UPR8 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
D13Ertd608eQ3UPR8 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
D13Ertd608eQ3UPR8 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
D13Ertd608eQ3UPR8 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
D13Ertd608eQ3UPR8 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
D13Ertd608eQ3UPR8 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
D13Ertd608eQ3UPR8 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
D13Ertd608eQ3UPR8 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
D13Ertd608eQ3UPR8 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
D13Ertd608eQ3UPR8 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
D13Ertd608eQ3UPR8 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
D13Ertd608eQ3UPR8 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
D13Ertd608eQ3UPR8 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
D13Ertd608eQ3UPR8 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.48■□□□□ 0.71
D13Ertd608eQ3UPR8 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
D13Ertd608eQ3UPR8 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
D13Ertd608eQ3UPR8 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
D13Ertd608eQ3UPR8 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
D13Ertd608eQ3UPR8 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
D13Ertd608eQ3UPR8 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
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D13Ertd608eQ3UPR8 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
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D13Ertd608eQ3UPR8 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
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D13Ertd608eQ3UPR8 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
D13Ertd608eQ3UPR8 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
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D13Ertd608eQ3UPR8 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
D13Ertd608eQ3UPR8 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
D13Ertd608eQ3UPR8 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
D13Ertd608eQ3UPR8 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
D13Ertd608eQ3UPR8 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
D13Ertd608eQ3UPR8 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
D13Ertd608eQ3UPR8 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
D13Ertd608eQ3UPR8 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
D13Ertd608eQ3UPR8 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC19.45■□□□□ 0.7
D13Ertd608eQ3UPR8 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
D13Ertd608eQ3UPR8 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
D13Ertd608eQ3UPR8 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
D13Ertd608eQ3UPR8 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
D13Ertd608eQ3UPR8 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
D13Ertd608eQ3UPR8 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
D13Ertd608eQ3UPR8 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
D13Ertd608eQ3UPR8 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
D13Ertd608eQ3UPR8 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
D13Ertd608eQ3UPR8 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
D13Ertd608eQ3UPR8 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
D13Ertd608eQ3UPR8 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
D13Ertd608eQ3UPR8 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
D13Ertd608eQ3UPR8 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
D13Ertd608eQ3UPR8 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC19.43■□□□□ 0.7
D13Ertd608eQ3UPR8 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
D13Ertd608eQ3UPR8 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
D13Ertd608eQ3UPR8 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
D13Ertd608eQ3UPR8 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
D13Ertd608eQ3UPR8 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
D13Ertd608eQ3UPR8 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
D13Ertd608eQ3UPR8 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
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