Protein–RNA interactions for Protein: Q3UIA2

Arhgap17, Rho GTPase-activating protein 17, mousemouse

Predictions only

Length 846 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arhgap17Q3UIA2 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Arhgap17Q3UIA2 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Arhgap17Q3UIA2 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Arhgap17Q3UIA2 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Arhgap17Q3UIA2 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Arhgap17Q3UIA2 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Arhgap17Q3UIA2 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Arhgap17Q3UIA2 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Arhgap17Q3UIA2 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Arhgap17Q3UIA2 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Arhgap17Q3UIA2 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Arhgap17Q3UIA2 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Arhgap17Q3UIA2 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Arhgap17Q3UIA2 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Arhgap17Q3UIA2 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Arhgap17Q3UIA2 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Arhgap17Q3UIA2 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Arhgap17Q3UIA2 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Arhgap17Q3UIA2 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Arhgap17Q3UIA2 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Arhgap17Q3UIA2 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Arhgap17Q3UIA2 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Arhgap17Q3UIA2 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Arhgap17Q3UIA2 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Arhgap17Q3UIA2 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Arhgap17Q3UIA2 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Arhgap17Q3UIA2 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Arhgap17Q3UIA2 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Arhgap17Q3UIA2 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Arhgap17Q3UIA2 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Arhgap17Q3UIA2 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Arhgap17Q3UIA2 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Arhgap17Q3UIA2 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Arhgap17Q3UIA2 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Arhgap17Q3UIA2 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Arhgap17Q3UIA2 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Arhgap17Q3UIA2 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Arhgap17Q3UIA2 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Arhgap17Q3UIA2 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Arhgap17Q3UIA2 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Arhgap17Q3UIA2 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Arhgap17Q3UIA2 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Arhgap17Q3UIA2 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Arhgap17Q3UIA2 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Arhgap17Q3UIA2 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Arhgap17Q3UIA2 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Arhgap17Q3UIA2 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Arhgap17Q3UIA2 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Arhgap17Q3UIA2 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Arhgap17Q3UIA2 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Arhgap17Q3UIA2 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Arhgap17Q3UIA2 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Arhgap17Q3UIA2 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Arhgap17Q3UIA2 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Arhgap17Q3UIA2 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Arhgap17Q3UIA2 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Arhgap17Q3UIA2 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Arhgap17Q3UIA2 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Arhgap17Q3UIA2 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Arhgap17Q3UIA2 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Arhgap17Q3UIA2 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Arhgap17Q3UIA2 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Arhgap17Q3UIA2 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Arhgap17Q3UIA2 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Arhgap17Q3UIA2 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Arhgap17Q3UIA2 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Arhgap17Q3UIA2 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Arhgap17Q3UIA2 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1
Arhgap17Q3UIA2 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Arhgap17Q3UIA2 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Arhgap17Q3UIA2 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Arhgap17Q3UIA2 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Arhgap17Q3UIA2 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Arhgap17Q3UIA2 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Arhgap17Q3UIA2 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Arhgap17Q3UIA2 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Arhgap17Q3UIA2 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Arhgap17Q3UIA2 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Arhgap17Q3UIA2 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Arhgap17Q3UIA2 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Arhgap17Q3UIA2 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Arhgap17Q3UIA2 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Arhgap17Q3UIA2 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Arhgap17Q3UIA2 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Arhgap17Q3UIA2 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Arhgap17Q3UIA2 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Arhgap17Q3UIA2 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Arhgap17Q3UIA2 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Arhgap17Q3UIA2 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Arhgap17Q3UIA2 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
Arhgap17Q3UIA2 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Arhgap17Q3UIA2 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Arhgap17Q3UIA2 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Arhgap17Q3UIA2 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Arhgap17Q3UIA2 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Arhgap17Q3UIA2 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Arhgap17Q3UIA2 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Arhgap17Q3UIA2 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Arhgap17Q3UIA2 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Arhgap17Q3UIA2 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms