Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHB8

Ccdc177, Coiled-coil domain-containing protein 177, mousemouse

Predictions only

Length 706 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc177Q3UHB8 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ccdc177Q3UHB8 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ccdc177Q3UHB8 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ccdc177Q3UHB8 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ccdc177Q3UHB8 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ccdc177Q3UHB8 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ccdc177Q3UHB8 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ccdc177Q3UHB8 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ccdc177Q3UHB8 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ccdc177Q3UHB8 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ccdc177Q3UHB8 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ccdc177Q3UHB8 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ccdc177Q3UHB8 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ccdc177Q3UHB8 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ccdc177Q3UHB8 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ccdc177Q3UHB8 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ccdc177Q3UHB8 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ccdc177Q3UHB8 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Ccdc177Q3UHB8 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ccdc177Q3UHB8 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ccdc177Q3UHB8 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ccdc177Q3UHB8 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ccdc177Q3UHB8 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ccdc177Q3UHB8 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ccdc177Q3UHB8 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ccdc177Q3UHB8 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ccdc177Q3UHB8 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ccdc177Q3UHB8 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ccdc177Q3UHB8 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ccdc177Q3UHB8 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ccdc177Q3UHB8 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ccdc177Q3UHB8 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ccdc177Q3UHB8 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ccdc177Q3UHB8 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ccdc177Q3UHB8 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ccdc177Q3UHB8 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ccdc177Q3UHB8 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ccdc177Q3UHB8 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Ccdc177Q3UHB8 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ccdc177Q3UHB8 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ccdc177Q3UHB8 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ccdc177Q3UHB8 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccdc177Q3UHB8 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccdc177Q3UHB8 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccdc177Q3UHB8 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccdc177Q3UHB8 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccdc177Q3UHB8 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccdc177Q3UHB8 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccdc177Q3UHB8 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccdc177Q3UHB8 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccdc177Q3UHB8 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccdc177Q3UHB8 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccdc177Q3UHB8 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccdc177Q3UHB8 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccdc177Q3UHB8 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccdc177Q3UHB8 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccdc177Q3UHB8 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccdc177Q3UHB8 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccdc177Q3UHB8 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccdc177Q3UHB8 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccdc177Q3UHB8 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccdc177Q3UHB8 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccdc177Q3UHB8 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccdc177Q3UHB8 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccdc177Q3UHB8 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccdc177Q3UHB8 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccdc177Q3UHB8 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccdc177Q3UHB8 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccdc177Q3UHB8 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccdc177Q3UHB8 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccdc177Q3UHB8 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccdc177Q3UHB8 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccdc177Q3UHB8 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccdc177Q3UHB8 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccdc177Q3UHB8 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccdc177Q3UHB8 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccdc177Q3UHB8 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccdc177Q3UHB8 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccdc177Q3UHB8 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccdc177Q3UHB8 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccdc177Q3UHB8 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccdc177Q3UHB8 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccdc177Q3UHB8 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccdc177Q3UHB8 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccdc177Q3UHB8 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccdc177Q3UHB8 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccdc177Q3UHB8 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccdc177Q3UHB8 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccdc177Q3UHB8 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccdc177Q3UHB8 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Ccdc177Q3UHB8 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Ccdc177Q3UHB8 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Ccdc177Q3UHB8 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Ccdc177Q3UHB8 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ccdc177Q3UHB8 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccdc177Q3UHB8 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccdc177Q3UHB8 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccdc177Q3UHB8 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccdc177Q3UHB8 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccdc177Q3UHB8 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms