Protein–RNA interactions for Protein: Q3UFY4

Rsph3a, Radial spoke head protein 3 homolog A, mousemouse

Predictions only

Length 516 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rsph3aQ3UFY4 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Rsph3aQ3UFY4 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Rsph3aQ3UFY4 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Rsph3aQ3UFY4 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Rsph3aQ3UFY4 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Rsph3aQ3UFY4 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Rsph3aQ3UFY4 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Rsph3aQ3UFY4 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Rsph3aQ3UFY4 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Rsph3aQ3UFY4 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Rsph3aQ3UFY4 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Rsph3aQ3UFY4 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.68
Rsph3aQ3UFY4 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Rsph3aQ3UFY4 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Rsph3aQ3UFY4 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Rsph3aQ3UFY4 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Rsph3aQ3UFY4 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Rsph3aQ3UFY4 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Rsph3aQ3UFY4 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Rsph3aQ3UFY4 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
Rsph3aQ3UFY4 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Rsph3aQ3UFY4 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
Rsph3aQ3UFY4 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Rsph3aQ3UFY4 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Rsph3aQ3UFY4 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Rsph3aQ3UFY4 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Rsph3aQ3UFY4 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Rsph3aQ3UFY4 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Rsph3aQ3UFY4 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Rsph3aQ3UFY4 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
Rsph3aQ3UFY4 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
Rsph3aQ3UFY4 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Rsph3aQ3UFY4 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Rsph3aQ3UFY4 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Rsph3aQ3UFY4 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Rsph3aQ3UFY4 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
Rsph3aQ3UFY4 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Rsph3aQ3UFY4 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Rsph3aQ3UFY4 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
Rsph3aQ3UFY4 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Rsph3aQ3UFY4 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
Rsph3aQ3UFY4 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Rsph3aQ3UFY4 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Rsph3aQ3UFY4 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Rsph3aQ3UFY4 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Rsph3aQ3UFY4 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Rsph3aQ3UFY4 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Rsph3aQ3UFY4 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Rsph3aQ3UFY4 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Rsph3aQ3UFY4 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
Rsph3aQ3UFY4 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Rsph3aQ3UFY4 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Rsph3aQ3UFY4 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
Rsph3aQ3UFY4 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Rsph3aQ3UFY4 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Rsph3aQ3UFY4 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
Rsph3aQ3UFY4 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Rsph3aQ3UFY4 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Rsph3aQ3UFY4 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Rsph3aQ3UFY4 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Rsph3aQ3UFY4 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Rsph3aQ3UFY4 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
Rsph3aQ3UFY4 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Rsph3aQ3UFY4 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Rsph3aQ3UFY4 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Rsph3aQ3UFY4 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Rsph3aQ3UFY4 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Rsph3aQ3UFY4 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Rsph3aQ3UFY4 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
Rsph3aQ3UFY4 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Rsph3aQ3UFY4 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Rsph3aQ3UFY4 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Rsph3aQ3UFY4 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Rsph3aQ3UFY4 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Rsph3aQ3UFY4 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Rsph3aQ3UFY4 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Rsph3aQ3UFY4 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Rsph3aQ3UFY4 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Rsph3aQ3UFY4 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Rsph3aQ3UFY4 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Rsph3aQ3UFY4 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Rsph3aQ3UFY4 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Rsph3aQ3UFY4 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
Rsph3aQ3UFY4 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Rsph3aQ3UFY4 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Rsph3aQ3UFY4 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Rsph3aQ3UFY4 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Rsph3aQ3UFY4 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Rsph3aQ3UFY4 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Rsph3aQ3UFY4 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Rsph3aQ3UFY4 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Rsph3aQ3UFY4 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Rsph3aQ3UFY4 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Rsph3aQ3UFY4 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Rsph3aQ3UFY4 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
Rsph3aQ3UFY4 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Rsph3aQ3UFY4 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Rsph3aQ3UFY4 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Rsph3aQ3UFY4 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Rsph3aQ3UFY4 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.1 ms