Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0P1

Palb2, Partner and localizer of BRCA2, mousemouse

Predictions only

Length 1,104 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Palb2Q3U0P1 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Palb2Q3U0P1 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Palb2Q3U0P1 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Palb2Q3U0P1 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Palb2Q3U0P1 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Palb2Q3U0P1 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Palb2Q3U0P1 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Palb2Q3U0P1 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Palb2Q3U0P1 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Palb2Q3U0P1 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Palb2Q3U0P1 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Palb2Q3U0P1 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Palb2Q3U0P1 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Palb2Q3U0P1 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Palb2Q3U0P1 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Palb2Q3U0P1 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Palb2Q3U0P1 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
Palb2Q3U0P1 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Palb2Q3U0P1 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Palb2Q3U0P1 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Palb2Q3U0P1 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Palb2Q3U0P1 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Palb2Q3U0P1 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Palb2Q3U0P1 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Palb2Q3U0P1 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Palb2Q3U0P1 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Palb2Q3U0P1 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Palb2Q3U0P1 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Palb2Q3U0P1 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Palb2Q3U0P1 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Palb2Q3U0P1 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Palb2Q3U0P1 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Palb2Q3U0P1 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Palb2Q3U0P1 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Palb2Q3U0P1 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Palb2Q3U0P1 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Palb2Q3U0P1 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Palb2Q3U0P1 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Palb2Q3U0P1 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Palb2Q3U0P1 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Palb2Q3U0P1 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Palb2Q3U0P1 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
Palb2Q3U0P1 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Palb2Q3U0P1 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Palb2Q3U0P1 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Palb2Q3U0P1 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC23.89■■□□□ 1.42
Palb2Q3U0P1 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
Palb2Q3U0P1 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Palb2Q3U0P1 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Palb2Q3U0P1 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Palb2Q3U0P1 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Palb2Q3U0P1 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
Palb2Q3U0P1 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Palb2Q3U0P1 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Palb2Q3U0P1 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Palb2Q3U0P1 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Palb2Q3U0P1 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Palb2Q3U0P1 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Palb2Q3U0P1 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Palb2Q3U0P1 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Palb2Q3U0P1 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Palb2Q3U0P1 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Palb2Q3U0P1 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Palb2Q3U0P1 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Palb2Q3U0P1 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Palb2Q3U0P1 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Palb2Q3U0P1 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Palb2Q3U0P1 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Palb2Q3U0P1 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Palb2Q3U0P1 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Palb2Q3U0P1 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Palb2Q3U0P1 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Palb2Q3U0P1 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Palb2Q3U0P1 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Palb2Q3U0P1 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Palb2Q3U0P1 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
Palb2Q3U0P1 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Palb2Q3U0P1 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Palb2Q3U0P1 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
Palb2Q3U0P1 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Palb2Q3U0P1 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Palb2Q3U0P1 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Palb2Q3U0P1 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Palb2Q3U0P1 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Palb2Q3U0P1 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Palb2Q3U0P1 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Palb2Q3U0P1 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Palb2Q3U0P1 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Palb2Q3U0P1 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Palb2Q3U0P1 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Palb2Q3U0P1 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Palb2Q3U0P1 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Palb2Q3U0P1 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Palb2Q3U0P1 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Palb2Q3U0P1 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Palb2Q3U0P1 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Palb2Q3U0P1 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Palb2Q3U0P1 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Palb2Q3U0P1 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Palb2Q3U0P1 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.3 ms