Protein–RNA interactions for Protein: Q3MI99

Ccbe1, Collagen and calcium-binding EGF domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 408 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccbe1Q3MI99 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ccbe1Q3MI99 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ccbe1Q3MI99 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ccbe1Q3MI99 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ccbe1Q3MI99 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ccbe1Q3MI99 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ccbe1Q3MI99 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ccbe1Q3MI99 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ccbe1Q3MI99 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ccbe1Q3MI99 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Ccbe1Q3MI99 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Ccbe1Q3MI99 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ccbe1Q3MI99 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Ccbe1Q3MI99 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ccbe1Q3MI99 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Ccbe1Q3MI99 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Ccbe1Q3MI99 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ccbe1Q3MI99 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ccbe1Q3MI99 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ccbe1Q3MI99 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ccbe1Q3MI99 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ccbe1Q3MI99 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ccbe1Q3MI99 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ccbe1Q3MI99 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ccbe1Q3MI99 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ccbe1Q3MI99 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ccbe1Q3MI99 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ccbe1Q3MI99 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ccbe1Q3MI99 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ccbe1Q3MI99 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ccbe1Q3MI99 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ccbe1Q3MI99 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ccbe1Q3MI99 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ccbe1Q3MI99 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ccbe1Q3MI99 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ccbe1Q3MI99 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ccbe1Q3MI99 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ccbe1Q3MI99 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ccbe1Q3MI99 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ccbe1Q3MI99 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ccbe1Q3MI99 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ccbe1Q3MI99 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ccbe1Q3MI99 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ccbe1Q3MI99 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ccbe1Q3MI99 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ccbe1Q3MI99 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ccbe1Q3MI99 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ccbe1Q3MI99 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ccbe1Q3MI99 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ccbe1Q3MI99 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ccbe1Q3MI99 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ccbe1Q3MI99 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ccbe1Q3MI99 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ccbe1Q3MI99 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ccbe1Q3MI99 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ccbe1Q3MI99 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ccbe1Q3MI99 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ccbe1Q3MI99 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ccbe1Q3MI99 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ccbe1Q3MI99 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ccbe1Q3MI99 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ccbe1Q3MI99 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ccbe1Q3MI99 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ccbe1Q3MI99 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ccbe1Q3MI99 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ccbe1Q3MI99 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ccbe1Q3MI99 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ccbe1Q3MI99 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ccbe1Q3MI99 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ccbe1Q3MI99 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ccbe1Q3MI99 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ccbe1Q3MI99 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Ccbe1Q3MI99 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ccbe1Q3MI99 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ccbe1Q3MI99 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ccbe1Q3MI99 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ccbe1Q3MI99 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ccbe1Q3MI99 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ccbe1Q3MI99 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ccbe1Q3MI99 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ccbe1Q3MI99 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ccbe1Q3MI99 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ccbe1Q3MI99 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ccbe1Q3MI99 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ccbe1Q3MI99 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ccbe1Q3MI99 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ccbe1Q3MI99 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ccbe1Q3MI99 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ccbe1Q3MI99 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ccbe1Q3MI99 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ccbe1Q3MI99 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ccbe1Q3MI99 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ccbe1Q3MI99 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ccbe1Q3MI99 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ccbe1Q3MI99 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ccbe1Q3MI99 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ccbe1Q3MI99 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ccbe1Q3MI99 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ccbe1Q3MI99 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ccbe1Q3MI99 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.1 ms