Protein–RNA interactions for Protein: Q0VBD0

Itgb8, Integrin beta, mousemouse

Predictions only

Length 767 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgb8Q0VBD0 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Itgb8Q0VBD0 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Itgb8Q0VBD0 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Itgb8Q0VBD0 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Itgb8Q0VBD0 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Itgb8Q0VBD0 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Itgb8Q0VBD0 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Itgb8Q0VBD0 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Itgb8Q0VBD0 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Itgb8Q0VBD0 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Itgb8Q0VBD0 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
Itgb8Q0VBD0 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Itgb8Q0VBD0 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Itgb8Q0VBD0 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Itgb8Q0VBD0 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
Itgb8Q0VBD0 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Itgb8Q0VBD0 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Itgb8Q0VBD0 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Itgb8Q0VBD0 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Itgb8Q0VBD0 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Itgb8Q0VBD0 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Itgb8Q0VBD0 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Itgb8Q0VBD0 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Itgb8Q0VBD0 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
Itgb8Q0VBD0 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
Itgb8Q0VBD0 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
Itgb8Q0VBD0 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Itgb8Q0VBD0 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Itgb8Q0VBD0 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Itgb8Q0VBD0 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Itgb8Q0VBD0 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Itgb8Q0VBD0 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Itgb8Q0VBD0 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Itgb8Q0VBD0 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Itgb8Q0VBD0 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Itgb8Q0VBD0 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Itgb8Q0VBD0 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Itgb8Q0VBD0 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Itgb8Q0VBD0 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Itgb8Q0VBD0 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Itgb8Q0VBD0 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Itgb8Q0VBD0 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Itgb8Q0VBD0 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Itgb8Q0VBD0 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Itgb8Q0VBD0 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Itgb8Q0VBD0 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Itgb8Q0VBD0 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Itgb8Q0VBD0 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Itgb8Q0VBD0 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
Itgb8Q0VBD0 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Itgb8Q0VBD0 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Itgb8Q0VBD0 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
Itgb8Q0VBD0 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Itgb8Q0VBD0 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
Itgb8Q0VBD0 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Itgb8Q0VBD0 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Itgb8Q0VBD0 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Itgb8Q0VBD0 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Itgb8Q0VBD0 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Itgb8Q0VBD0 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Itgb8Q0VBD0 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Itgb8Q0VBD0 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Itgb8Q0VBD0 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Itgb8Q0VBD0 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Itgb8Q0VBD0 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Itgb8Q0VBD0 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Itgb8Q0VBD0 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Itgb8Q0VBD0 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Itgb8Q0VBD0 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Itgb8Q0VBD0 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Itgb8Q0VBD0 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Itgb8Q0VBD0 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Itgb8Q0VBD0 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Itgb8Q0VBD0 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Itgb8Q0VBD0 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
Itgb8Q0VBD0 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Itgb8Q0VBD0 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Itgb8Q0VBD0 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Itgb8Q0VBD0 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Itgb8Q0VBD0 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Itgb8Q0VBD0 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Itgb8Q0VBD0 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
Itgb8Q0VBD0 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Itgb8Q0VBD0 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Itgb8Q0VBD0 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Itgb8Q0VBD0 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Itgb8Q0VBD0 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Itgb8Q0VBD0 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Itgb8Q0VBD0 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Itgb8Q0VBD0 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Itgb8Q0VBD0 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Itgb8Q0VBD0 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Itgb8Q0VBD0 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Itgb8Q0VBD0 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Itgb8Q0VBD0 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Itgb8Q0VBD0 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Itgb8Q0VBD0 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Itgb8Q0VBD0 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Itgb8Q0VBD0 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Itgb8Q0VBD0 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms