Protein–RNA interactions for Protein: Q08189

Tgm3, Protein-glutamine gamma-glutamyltransferase E, mousemouse

Predictions only

Length 693 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tgm3Q08189 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tgm3Q08189 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tgm3Q08189 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tgm3Q08189 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tgm3Q08189 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tgm3Q08189 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tgm3Q08189 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tgm3Q08189 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Tgm3Q08189 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Tgm3Q08189 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tgm3Q08189 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tgm3Q08189 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tgm3Q08189 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tgm3Q08189 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tgm3Q08189 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tgm3Q08189 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tgm3Q08189 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tgm3Q08189 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tgm3Q08189 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tgm3Q08189 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tgm3Q08189 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tgm3Q08189 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tgm3Q08189 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tgm3Q08189 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tgm3Q08189 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tgm3Q08189 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tgm3Q08189 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Tgm3Q08189 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Tgm3Q08189 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Tgm3Q08189 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Tgm3Q08189 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Tgm3Q08189 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Tgm3Q08189 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Tgm3Q08189 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
Tgm3Q08189 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Tgm3Q08189 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Tgm3Q08189 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Tgm3Q08189 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Tgm3Q08189 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
Tgm3Q08189 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Tgm3Q08189 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Tgm3Q08189 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Tgm3Q08189 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Tgm3Q08189 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tgm3Q08189 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tgm3Q08189 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tgm3Q08189 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tgm3Q08189 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Tgm3Q08189 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Tgm3Q08189 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tgm3Q08189 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Tgm3Q08189 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Tgm3Q08189 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Tgm3Q08189 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Tgm3Q08189 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Tgm3Q08189 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Tgm3Q08189 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Tgm3Q08189 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Tgm3Q08189 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Tgm3Q08189 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Tgm3Q08189 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Tgm3Q08189 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Tgm3Q08189 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Tgm3Q08189 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Tgm3Q08189 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Tgm3Q08189 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tgm3Q08189 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tgm3Q08189 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tgm3Q08189 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tgm3Q08189 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tgm3Q08189 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tgm3Q08189 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tgm3Q08189 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tgm3Q08189 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tgm3Q08189 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tgm3Q08189 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tgm3Q08189 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tgm3Q08189 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tgm3Q08189 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tgm3Q08189 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tgm3Q08189 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tgm3Q08189 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tgm3Q08189 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tgm3Q08189 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tgm3Q08189 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tgm3Q08189 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tgm3Q08189 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tgm3Q08189 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tgm3Q08189 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tgm3Q08189 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tgm3Q08189 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Tgm3Q08189 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Tgm3Q08189 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Tgm3Q08189 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Tgm3Q08189 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Tgm3Q08189 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Tgm3Q08189 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Tgm3Q08189 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Tgm3Q08189 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Tgm3Q08189 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.8 ms