Protein–RNA interactions for Protein: Q07916

Pou6f1, POU domain, class 6, transcription factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 301 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pou6f1Q07916 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Pou6f1Q07916 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Pou6f1Q07916 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Pou6f1Q07916 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Pou6f1Q07916 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Pou6f1Q07916 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Pou6f1Q07916 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Pou6f1Q07916 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Pou6f1Q07916 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Pou6f1Q07916 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Pou6f1Q07916 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Pou6f1Q07916 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Pou6f1Q07916 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Pou6f1Q07916 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Pou6f1Q07916 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Pou6f1Q07916 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Pou6f1Q07916 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Pou6f1Q07916 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Pou6f1Q07916 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Pou6f1Q07916 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Pou6f1Q07916 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Pou6f1Q07916 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Pou6f1Q07916 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Pou6f1Q07916 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Pou6f1Q07916 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Pou6f1Q07916 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Pou6f1Q07916 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Pou6f1Q07916 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Pou6f1Q07916 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Pou6f1Q07916 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Pou6f1Q07916 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Pou6f1Q07916 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Pou6f1Q07916 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Pou6f1Q07916 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Pou6f1Q07916 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Pou6f1Q07916 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Pou6f1Q07916 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Pou6f1Q07916 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Pou6f1Q07916 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Pou6f1Q07916 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Pou6f1Q07916 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Pou6f1Q07916 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Pou6f1Q07916 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Pou6f1Q07916 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Pou6f1Q07916 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Pou6f1Q07916 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Pou6f1Q07916 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Pou6f1Q07916 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Pou6f1Q07916 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Pou6f1Q07916 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Pou6f1Q07916 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Pou6f1Q07916 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Pou6f1Q07916 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Pou6f1Q07916 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Pou6f1Q07916 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Pou6f1Q07916 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Pou6f1Q07916 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Pou6f1Q07916 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Pou6f1Q07916 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Pou6f1Q07916 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Pou6f1Q07916 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Pou6f1Q07916 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Pou6f1Q07916 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Pou6f1Q07916 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Pou6f1Q07916 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Pou6f1Q07916 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Pou6f1Q07916 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Pou6f1Q07916 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Pou6f1Q07916 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Pou6f1Q07916 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Pou6f1Q07916 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Pou6f1Q07916 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Pou6f1Q07916 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Pou6f1Q07916 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Pou6f1Q07916 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Pou6f1Q07916 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Pou6f1Q07916 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Pou6f1Q07916 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Pou6f1Q07916 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Pou6f1Q07916 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Pou6f1Q07916 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Pou6f1Q07916 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Pou6f1Q07916 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Pou6f1Q07916 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Pou6f1Q07916 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Pou6f1Q07916 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Pou6f1Q07916 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Pou6f1Q07916 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Pou6f1Q07916 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Pou6f1Q07916 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Pou6f1Q07916 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Pou6f1Q07916 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Pou6f1Q07916 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Pou6f1Q07916 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Pou6f1Q07916 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Pou6f1Q07916 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Pou6f1Q07916 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Pou6f1Q07916 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Pou6f1Q07916 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Pou6f1Q07916 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms