Protein–RNA interactions for Protein: Q05793

Hspg2, Basement membrane-specific heparan sulfate proteoglycan core protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 3,707 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hspg2Q05793 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hspg2Q05793 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hspg2Q05793 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hspg2Q05793 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hspg2Q05793 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hspg2Q05793 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hspg2Q05793 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hspg2Q05793 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hspg2Q05793 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hspg2Q05793 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hspg2Q05793 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hspg2Q05793 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Hspg2Q05793 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Hspg2Q05793 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hspg2Q05793 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hspg2Q05793 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hspg2Q05793 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hspg2Q05793 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hspg2Q05793 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hspg2Q05793 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Hspg2Q05793 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hspg2Q05793 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hspg2Q05793 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hspg2Q05793 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Hspg2Q05793 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hspg2Q05793 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hspg2Q05793 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hspg2Q05793 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hspg2Q05793 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hspg2Q05793 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hspg2Q05793 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hspg2Q05793 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hspg2Q05793 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hspg2Q05793 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hspg2Q05793 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hspg2Q05793 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hspg2Q05793 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hspg2Q05793 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hspg2Q05793 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hspg2Q05793 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hspg2Q05793 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hspg2Q05793 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hspg2Q05793 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hspg2Q05793 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hspg2Q05793 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Hspg2Q05793 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hspg2Q05793 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hspg2Q05793 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hspg2Q05793 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Hspg2Q05793 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hspg2Q05793 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hspg2Q05793 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hspg2Q05793 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hspg2Q05793 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hspg2Q05793 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hspg2Q05793 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hspg2Q05793 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hspg2Q05793 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hspg2Q05793 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hspg2Q05793 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hspg2Q05793 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hspg2Q05793 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hspg2Q05793 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Hspg2Q05793 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hspg2Q05793 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hspg2Q05793 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hspg2Q05793 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hspg2Q05793 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hspg2Q05793 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hspg2Q05793 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hspg2Q05793 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hspg2Q05793 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hspg2Q05793 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hspg2Q05793 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hspg2Q05793 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hspg2Q05793 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hspg2Q05793 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hspg2Q05793 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hspg2Q05793 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hspg2Q05793 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hspg2Q05793 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hspg2Q05793 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hspg2Q05793 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hspg2Q05793 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Hspg2Q05793 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hspg2Q05793 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Hspg2Q05793 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hspg2Q05793 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hspg2Q05793 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hspg2Q05793 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hspg2Q05793 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hspg2Q05793 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hspg2Q05793 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hspg2Q05793 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hspg2Q05793 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hspg2Q05793 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hspg2Q05793 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hspg2Q05793 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hspg2Q05793 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hspg2Q05793 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.2 ms