Protein–RNA interactions for Protein: Q04207

Rela, Transcription factor p65, mousemouse

Predictions only

Length 549 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RelaQ04207 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RelaQ04207 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
RelaQ04207 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RelaQ04207 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RelaQ04207 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RelaQ04207 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RelaQ04207 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RelaQ04207 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RelaQ04207 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RelaQ04207 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RelaQ04207 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RelaQ04207 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RelaQ04207 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RelaQ04207 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RelaQ04207 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RelaQ04207 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RelaQ04207 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RelaQ04207 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RelaQ04207 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RelaQ04207 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RelaQ04207 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RelaQ04207 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RelaQ04207 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RelaQ04207 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RelaQ04207 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RelaQ04207 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RelaQ04207 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RelaQ04207 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RelaQ04207 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
RelaQ04207 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
RelaQ04207 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RelaQ04207 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RelaQ04207 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
RelaQ04207 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
RelaQ04207 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RelaQ04207 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RelaQ04207 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RelaQ04207 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RelaQ04207 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RelaQ04207 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RelaQ04207 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RelaQ04207 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RelaQ04207 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RelaQ04207 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RelaQ04207 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
RelaQ04207 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RelaQ04207 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
RelaQ04207 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RelaQ04207 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RelaQ04207 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RelaQ04207 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RelaQ04207 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RelaQ04207 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RelaQ04207 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RelaQ04207 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RelaQ04207 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RelaQ04207 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RelaQ04207 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RelaQ04207 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RelaQ04207 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RelaQ04207 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RelaQ04207 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RelaQ04207 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RelaQ04207 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RelaQ04207 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RelaQ04207 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RelaQ04207 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RelaQ04207 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RelaQ04207 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RelaQ04207 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RelaQ04207 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RelaQ04207 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RelaQ04207 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RelaQ04207 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RelaQ04207 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RelaQ04207 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RelaQ04207 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RelaQ04207 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RelaQ04207 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
RelaQ04207 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
RelaQ04207 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RelaQ04207 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
RelaQ04207 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RelaQ04207 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RelaQ04207 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RelaQ04207 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RelaQ04207 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RelaQ04207 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RelaQ04207 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RelaQ04207 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RelaQ04207 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RelaQ04207 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RelaQ04207 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RelaQ04207 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RelaQ04207 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RelaQ04207 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RelaQ04207 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RelaQ04207 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RelaQ04207 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RelaQ04207 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53 ms