Protein–RNA interactions for Protein: Q03404

Tff2, Trefoil factor 2, mousemouse

Predictions only

Length 129 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tff2Q03404 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Tff2Q03404 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Tff2Q03404 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Tff2Q03404 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Tff2Q03404 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Tff2Q03404 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Tff2Q03404 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Tff2Q03404 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Tff2Q03404 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Tff2Q03404 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Tff2Q03404 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Tff2Q03404 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Tff2Q03404 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Tff2Q03404 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Tff2Q03404 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Tff2Q03404 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Tff2Q03404 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Tff2Q03404 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Tff2Q03404 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Tff2Q03404 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
Tff2Q03404 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Tff2Q03404 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Tff2Q03404 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Tff2Q03404 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Tff2Q03404 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Tff2Q03404 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Tff2Q03404 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Tff2Q03404 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Tff2Q03404 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Tff2Q03404 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Tff2Q03404 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Tff2Q03404 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Tff2Q03404 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Tff2Q03404 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Tff2Q03404 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Tff2Q03404 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Tff2Q03404 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Tff2Q03404 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Tff2Q03404 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Tff2Q03404 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Tff2Q03404 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Tff2Q03404 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Tff2Q03404 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Tff2Q03404 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Tff2Q03404 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Tff2Q03404 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Tff2Q03404 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Tff2Q03404 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Tff2Q03404 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Tff2Q03404 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Tff2Q03404 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Tff2Q03404 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Tff2Q03404 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Tff2Q03404 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Tff2Q03404 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Tff2Q03404 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Tff2Q03404 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Tff2Q03404 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Tff2Q03404 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
Tff2Q03404 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Tff2Q03404 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Tff2Q03404 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Tff2Q03404 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Tff2Q03404 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Tff2Q03404 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Tff2Q03404 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Tff2Q03404 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Tff2Q03404 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Tff2Q03404 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Tff2Q03404 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
Tff2Q03404 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Tff2Q03404 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Tff2Q03404 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Tff2Q03404 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Tff2Q03404 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
Tff2Q03404 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Tff2Q03404 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Tff2Q03404 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Tff2Q03404 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
Tff2Q03404 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Tff2Q03404 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Tff2Q03404 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Tff2Q03404 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Tff2Q03404 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
Tff2Q03404 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Tff2Q03404 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Tff2Q03404 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Tff2Q03404 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Tff2Q03404 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Tff2Q03404 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Tff2Q03404 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
Tff2Q03404 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Tff2Q03404 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Tff2Q03404 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Tff2Q03404 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Tff2Q03404 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Tff2Q03404 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Tff2Q03404 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Tff2Q03404 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
Tff2Q03404 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 81.5 ms