Protein–RNA interactions for Protein: Q03147

Cdk7, Cyclin-dependent kinase 7, mousemouse

Predictions only

Length 346 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdk7Q03147 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cdk7Q03147 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cdk7Q03147 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cdk7Q03147 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cdk7Q03147 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cdk7Q03147 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cdk7Q03147 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cdk7Q03147 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cdk7Q03147 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cdk7Q03147 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cdk7Q03147 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cdk7Q03147 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cdk7Q03147 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cdk7Q03147 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cdk7Q03147 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cdk7Q03147 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cdk7Q03147 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cdk7Q03147 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cdk7Q03147 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cdk7Q03147 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cdk7Q03147 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cdk7Q03147 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cdk7Q03147 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cdk7Q03147 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cdk7Q03147 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cdk7Q03147 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cdk7Q03147 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cdk7Q03147 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cdk7Q03147 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cdk7Q03147 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cdk7Q03147 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cdk7Q03147 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cdk7Q03147 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cdk7Q03147 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cdk7Q03147 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cdk7Q03147 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cdk7Q03147 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cdk7Q03147 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cdk7Q03147 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Cdk7Q03147 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cdk7Q03147 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cdk7Q03147 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cdk7Q03147 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cdk7Q03147 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cdk7Q03147 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cdk7Q03147 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cdk7Q03147 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cdk7Q03147 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cdk7Q03147 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cdk7Q03147 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cdk7Q03147 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cdk7Q03147 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cdk7Q03147 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cdk7Q03147 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cdk7Q03147 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cdk7Q03147 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cdk7Q03147 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cdk7Q03147 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cdk7Q03147 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cdk7Q03147 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cdk7Q03147 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cdk7Q03147 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Cdk7Q03147 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cdk7Q03147 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cdk7Q03147 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cdk7Q03147 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cdk7Q03147 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Cdk7Q03147 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cdk7Q03147 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cdk7Q03147 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cdk7Q03147 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cdk7Q03147 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cdk7Q03147 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cdk7Q03147 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cdk7Q03147 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cdk7Q03147 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cdk7Q03147 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Cdk7Q03147 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cdk7Q03147 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cdk7Q03147 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cdk7Q03147 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cdk7Q03147 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cdk7Q03147 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cdk7Q03147 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cdk7Q03147 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cdk7Q03147 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cdk7Q03147 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cdk7Q03147 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cdk7Q03147 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cdk7Q03147 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cdk7Q03147 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cdk7Q03147 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cdk7Q03147 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cdk7Q03147 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cdk7Q03147 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cdk7Q03147 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cdk7Q03147 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cdk7Q03147 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cdk7Q03147 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cdk7Q03147 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.2 ms