Protein–RNA interactions for Protein: Q02853

Mmp11, Stromelysin-3, mousemouse

Predictions only

Length 492 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mmp11Q02853 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Mmp11Q02853 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Mmp11Q02853 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Mmp11Q02853 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Mmp11Q02853 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Mmp11Q02853 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Mmp11Q02853 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Mmp11Q02853 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Mmp11Q02853 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Mmp11Q02853 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Mmp11Q02853 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Mmp11Q02853 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
Mmp11Q02853 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Mmp11Q02853 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Mmp11Q02853 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Mmp11Q02853 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Mmp11Q02853 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Mmp11Q02853 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Mmp11Q02853 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Mmp11Q02853 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Mmp11Q02853 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Mmp11Q02853 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Mmp11Q02853 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Mmp11Q02853 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Mmp11Q02853 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
Mmp11Q02853 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Mmp11Q02853 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Mmp11Q02853 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Mmp11Q02853 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Mmp11Q02853 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Mmp11Q02853 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Mmp11Q02853 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Mmp11Q02853 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Mmp11Q02853 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Mmp11Q02853 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Mmp11Q02853 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Mmp11Q02853 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Mmp11Q02853 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Mmp11Q02853 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Mmp11Q02853 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Mmp11Q02853 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Mmp11Q02853 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Mmp11Q02853 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Mmp11Q02853 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Mmp11Q02853 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
Mmp11Q02853 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Mmp11Q02853 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Mmp11Q02853 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Mmp11Q02853 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Mmp11Q02853 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Mmp11Q02853 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Mmp11Q02853 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Mmp11Q02853 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Mmp11Q02853 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Mmp11Q02853 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Mmp11Q02853 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Mmp11Q02853 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Mmp11Q02853 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Mmp11Q02853 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Mmp11Q02853 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Mmp11Q02853 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Mmp11Q02853 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Mmp11Q02853 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Mmp11Q02853 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Mmp11Q02853 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Mmp11Q02853 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Mmp11Q02853 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Mmp11Q02853 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Mmp11Q02853 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Mmp11Q02853 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Mmp11Q02853 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Mmp11Q02853 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Mmp11Q02853 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Mmp11Q02853 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Mmp11Q02853 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Mmp11Q02853 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Mmp11Q02853 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Mmp11Q02853 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Mmp11Q02853 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Mmp11Q02853 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Mmp11Q02853 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Mmp11Q02853 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Mmp11Q02853 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Mmp11Q02853 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Mmp11Q02853 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Mmp11Q02853 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Mmp11Q02853 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Mmp11Q02853 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Mmp11Q02853 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Mmp11Q02853 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Mmp11Q02853 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Mmp11Q02853 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Mmp11Q02853 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Mmp11Q02853 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Mmp11Q02853 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Mmp11Q02853 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Mmp11Q02853 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Mmp11Q02853 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Mmp11Q02853 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Mmp11Q02853 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.4 ms